104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0101 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  100 
 
 		 268 aa  557  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  89.93 
 
 		 268 aa  513  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  78.36 
 
 		 275 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  77.9 
 
 		 267 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  77.99 
 
 		 268 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  77.99 
 
 		 268 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  76.69 
 
 		 271 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  75.57 
 
 		 262 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  74.33 
 
 		 258 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  67.94 
 
 		 266 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  69.58 
 
 		 259 aa  376  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  68.7 
 
 		 259 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  65.65 
 
 		 260 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  66.28 
 
 		 260 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  63.32 
 
 		 260 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  61.45 
 
 		 262 aa  343  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  61.92 
 
 		 260 aa  341  5.999999999999999e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  61.78 
 
 		 262 aa  331  9e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  60.7 
 
 		 263 aa  328  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  56.42 
 
 		 258 aa  305  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  54.58 
 
 		 261 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  45.56 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  45.98 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  45.59 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  42.97 
 
 		 283 aa  201  7e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  40.61 
 
 		 255 aa  198  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  42.25 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  40.62 
 
 		 270 aa  188  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  40.53 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  38.7 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  35.11 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  38.28 
 
 		 236 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  26.04 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  25.66 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  24.71 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  26.86 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  27 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  26.03 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  25 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  26.7 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  26.58 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  27.54 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  26.47 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  27.4 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  29.35 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  23.22 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  25.19 
 
 		 216 aa  54.7  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  28.02 
 
 		 220 aa  52.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  25.43 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  25.43 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  25.43 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  25.43 
 
 		 210 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  25.43 
 
 		 210 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  25.43 
 
 		 377 aa  52  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  25.43 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  25.43 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  25.85 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  25.43 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  26.38 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  24.43 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  25 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  26.13 
 
 		 205 aa  50.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  26.47 
 
 		 221 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  27.51 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  25 
 
 		 258 aa  49.7  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  26.83 
 
 		 219 aa  49.3  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  27.14 
 
 		 211 aa  48.9  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  24.22 
 
 		 213 aa  48.9  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  23.87 
 
 		 226 aa  48.9  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  26.53 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  30.67 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  23.72 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  25.68 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  27.31 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  26.61 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  27.31 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  25.12 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  24.03 
 
 		 267 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  24.19 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  30 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  26.64 
 
 		 329 aa  46.2  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  29.36 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  23.6 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  24.04 
 
 		 215 aa  45.8  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  28.57 
 
 		 268 aa  45.4  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  28.77 
 
 		 280 aa  45.4  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  25.26 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  25 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  27.06 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  22.98 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  26.2 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  25 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  24.67 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  25.32 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  25 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  26.34 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  25.56 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  24.5 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  27.07 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  27.54 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>