205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2407 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  100 
 
 		 267 aa  540  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  50.78 
 
 		 270 aa  226  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  42.91 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  42.64 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  43.28 
 
 		 273 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  40.52 
 
 		 280 aa  162  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  41.74 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  39.46 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  35.93 
 
 		 329 aa  145  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  35.69 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  42.99 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  38.99 
 
 		 335 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  42.61 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  36.96 
 
 		 342 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  37.5 
 
 		 321 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  35.48 
 
 		 398 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  36.49 
 
 		 318 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  30.3 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  33.01 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  29.55 
 
 		 315 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  33.48 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  33.48 
 
 		 332 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  31.8 
 
 		 351 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  31.8 
 
 		 351 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  27.92 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  27.92 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  32.58 
 
 		 331 aa  88.6  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  33.48 
 
 		 329 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  33.48 
 
 		 329 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  33.48 
 
 		 329 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  30.92 
 
 		 311 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  30.23 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  31.58 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  27.1 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  27.34 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  27.34 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  29.64 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  33.33 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  29.78 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  31.65 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  29.33 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  33.33 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  30.71 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  35.07 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  31.87 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  29.17 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  28.3 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  27.52 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  28.71 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  28.25 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  29.41 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  33.17 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  28.91 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  28.97 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  28.47 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  27.21 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  29.43 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  33.19 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  31.17 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  32.23 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  27.59 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  29.87 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  31.17 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  30.04 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  28.35 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  25.46 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  25.8 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  26.63 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  29.49 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  27.31 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  30.23 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  24.61 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  30.19 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  31.6 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  29.45 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  32.62 
 
 		 352 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  27.16 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  29.2 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  25.91 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  27.27 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  28.04 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  30.32 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  34.78 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  27.11 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  30.53 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  26.67 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  28.02 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  25.94 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  25.54 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  25.57 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  27.31 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  31.38 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  25.48 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1500  cyclase family protein  26.92 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.256572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  29.53 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  26.32 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  26.27 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  23.77 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  25.99 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  26.42 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>