103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1999 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  100 
 
 
307 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  59.42 
 
 
309 aa  331  9e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  38.03 
 
 
287 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  37.99 
 
 
321 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  34.49 
 
 
318 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  34.66 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  34.66 
 
 
332 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  32.82 
 
 
329 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  32.82 
 
 
329 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  32.82 
 
 
329 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  29.49 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  42.61 
 
 
267 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  29.84 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  34.25 
 
 
344 aa  126  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  28.84 
 
 
320 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  32.08 
 
 
311 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  31.85 
 
 
331 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  30.65 
 
 
327 aa  115  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  29.62 
 
 
317 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  30.72 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  29.46 
 
 
351 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  29.46 
 
 
351 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  28.52 
 
 
329 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  30.65 
 
 
336 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  30.94 
 
 
308 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  30.65 
 
 
335 aa  102  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  30.32 
 
 
335 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  30.32 
 
 
336 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  27.54 
 
 
315 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  29.1 
 
 
270 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  30.03 
 
 
345 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  27.48 
 
 
319 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  27.81 
 
 
311 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  30.32 
 
 
344 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  30.03 
 
 
336 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  32.09 
 
 
342 aa  99  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  28.65 
 
 
372 aa  97.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  35.11 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  28.4 
 
 
344 aa  96.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  27.69 
 
 
335 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  29.46 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  27.54 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  27.64 
 
 
354 aa  92.8  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  28.06 
 
 
329 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  35.45 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  28.78 
 
 
342 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  25.25 
 
 
311 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  27.54 
 
 
348 aa  89  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  27.36 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  25.58 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  27.01 
 
 
350 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  27.06 
 
 
341 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  26.33 
 
 
340 aa  86.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  27.27 
 
 
342 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  27.7 
 
 
340 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  27.7 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  33.19 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  33.04 
 
 
270 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  26.39 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  32.02 
 
 
280 aa  84  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  24.92 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  29.23 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  25.14 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  25.14 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  26.2 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  26.44 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  25.44 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  25.44 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  24.36 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  25.07 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  22.36 
 
 
320 aa  63.5  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01054  conserved hypothetical protein  26.86 
 
 
382 aa  61.6  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  26.15 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1948  hypothetical protein  30.88 
 
 
239 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645975  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0965  hypothetical protein  30.88 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1251  hypothetical protein  30.88 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.378284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2226  hypothetical protein  30.88 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.906086  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  28.5 
 
 
215 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0099  hypothetical protein  27.33 
 
 
327 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  33.85 
 
 
249 aa  56.2  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  27.78 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0343  hypothetical protein  36.56 
 
 
127 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1526  hypothetical protein  36.56 
 
 
127 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1716  hypothetical protein  36.56 
 
 
127 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0106358  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0377  hypothetical protein  36.56 
 
 
127 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  25 
 
 
219 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  25.21 
 
 
287 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  29.32 
 
 
264 aa  49.3  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  24.43 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10146  conserved hypothetical protein  22.71 
 
 
326 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  25.35 
 
 
236 aa  47  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  27.23 
 
 
220 aa  47  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  29.2 
 
 
212 aa  47  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  29.95 
 
 
253 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  24.31 
 
 
210 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  22.36 
 
 
290 aa  46.2  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  31.4 
 
 
215 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  24.51 
 
 
347 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  24.91 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  36 
 
 
237 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>