101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1165 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  100 
 
 		 342 aa  687    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  34.59 
 
 		 308 aa  166  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  40.85 
 
 		 270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  40.58 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  32.31 
 
 		 329 aa  149  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  33.11 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  36.26 
 
 		 335 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  37.73 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  32.08 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  31.74 
 
 		 315 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  38.97 
 
 		 273 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  32.41 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  31.67 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  31.96 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  36.96 
 
 		 267 aa  126  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  35.32 
 
 		 265 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  30.82 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  30.63 
 
 		 314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  30.63 
 
 		 314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  28.23 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  32.13 
 
 		 318 aa  109  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  26.58 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  26.58 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  32.09 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  32.48 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  29.49 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  35.41 
 
 		 270 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  30.47 
 
 		 329 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  30.47 
 
 		 329 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  30.47 
 
 		 329 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  34.8 
 
 		 309 aa  89.7  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  25.73 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  28.57 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  30.41 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  25.73 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  34.76 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  34.76 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  27.96 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  34.13 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  27.8 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  30.86 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  30.68 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  30.68 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  28.61 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  30.46 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  24.03 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  32.95 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  33.33 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  27.78 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  24.77 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  27.6 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  31.82 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  31.95 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  29.91 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  31.38 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  31.36 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  30.64 
 
 		 356 aa  57  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  25.63 
 
 		 342 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  28.49 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  30.77 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  30.77 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  30.77 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  30.77 
 
 		 335 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  30.77 
 
 		 335 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  30.06 
 
 		 342 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  30.29 
 
 		 341 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  27.1 
 
 		 280 aa  53.1  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  27.12 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  29.71 
 
 		 353 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  25.48 
 
 		 223 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  31.28 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  29.07 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  28.62 
 
 		 220 aa  50.8  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  24.51 
 
 		 276 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  25.38 
 
 		 347 aa  50.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10146  conserved hypothetical protein  25.96 
 
 		 326 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  27.75 
 
 		 372 aa  50.1  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  31.43 
 
 		 249 aa  50.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  27.33 
 
 		 344 aa  49.7  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  25.57 
 
 		 215 aa  49.3  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  26.15 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  25.23 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  25.69 
 
 		 210 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  27.11 
 
 		 253 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  31.67 
 
 		 208 aa  47.4  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  27.08 
 
 		 280 aa  46.2  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  33.55 
 
 		 210 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  25.23 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  25.23 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  25.23 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  25.23 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  24.77 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  25.23 
 
 		 210 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  26.67 
 
 		 264 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  21.82 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  27.48 
 
 		 259 aa  43.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  24.77 
 
 		 210 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0343  hypothetical protein  33 
 
 		 127 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1526  hypothetical protein  33 
 
 		 127 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1716  hypothetical protein  33 
 
 		 127 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0106358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>