101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2682 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  100 
 
 
287 aa  578  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  43.81 
 
 
329 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  43.81 
 
 
329 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  43.81 
 
 
329 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  41.69 
 
 
332 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  41.99 
 
 
318 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  41.88 
 
 
321 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  42.41 
 
 
344 aa  226  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  40.6 
 
 
332 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  42.48 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  40.33 
 
 
331 aa  185  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  36.39 
 
 
322 aa  171  9e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  35.86 
 
 
320 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  38.39 
 
 
307 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  34.43 
 
 
320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  37.38 
 
 
327 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  34.87 
 
 
317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  35.29 
 
 
322 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  36.69 
 
 
309 aa  135  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  33.82 
 
 
273 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  30.9 
 
 
352 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  32.23 
 
 
336 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  31.93 
 
 
336 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  32.23 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  31.93 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  32.23 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  32.23 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  32.23 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  32.84 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  33.46 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  29.86 
 
 
350 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  29.87 
 
 
308 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  32.73 
 
 
342 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  31.33 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  27.68 
 
 
312 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  33.23 
 
 
341 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  26.64 
 
 
320 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  30.43 
 
 
329 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  30.08 
 
 
362 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  30.4 
 
 
372 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  30.08 
 
 
362 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  32.39 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  28.86 
 
 
311 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  32.71 
 
 
265 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  27.8 
 
 
311 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  30.56 
 
 
348 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  29.43 
 
 
315 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  31.29 
 
 
354 aa  106  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  26.39 
 
 
314 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  26.39 
 
 
314 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  28.12 
 
 
329 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  29.63 
 
 
352 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  31.97 
 
 
280 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  28.52 
 
 
319 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  32.27 
 
 
323 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  30.77 
 
 
340 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01054  conserved hypothetical protein  30.36 
 
 
382 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  31.33 
 
 
335 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  27.16 
 
 
351 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  27.16 
 
 
351 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  29.34 
 
 
353 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  29.69 
 
 
343 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  31.64 
 
 
340 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  26.42 
 
 
320 aa  97.8  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  26.21 
 
 
321 aa  97.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  30.95 
 
 
356 aa  97.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  29.32 
 
 
347 aa  91.3  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  28.9 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  28.34 
 
 
398 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10146  conserved hypothetical protein  28.01 
 
 
326 aa  86.3  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  28.32 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0099  hypothetical protein  29 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  29.78 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  33.33 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0343  hypothetical protein  36.97 
 
 
127 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1526  hypothetical protein  36.97 
 
 
127 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1716  hypothetical protein  36.97 
 
 
127 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0106358  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0377  hypothetical protein  36.97 
 
 
127 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1948  hypothetical protein  31.79 
 
 
239 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645975  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0965  hypothetical protein  31.79 
 
 
248 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1251  hypothetical protein  31.79 
 
 
248 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.378284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2226  hypothetical protein  31.79 
 
 
248 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.906086  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  28.17 
 
 
262 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  26.25 
 
 
264 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  27.22 
 
 
223 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  29.53 
 
 
249 aa  52.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  24.81 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  27.06 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  29.38 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  26.12 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  27.05 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  27.96 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  27.34 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3386  cyclase family protein  37.23 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  26.46 
 
 
259 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0143  hypothetical protein  32.69 
 
 
209 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0202764  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  27.11 
 
 
257 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  26.43 
 
 
259 aa  43.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  28.88 
 
 
259 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>