173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2377 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  100 
 
 		 335 aa  684    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  58.21 
 
 		 329 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  62.46 
 
 		 329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  50 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  36.33 
 
 		 270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  30.7 
 
 		 321 aa  152  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  32.42 
 
 		 319 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  36.26 
 
 		 342 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  31.53 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  38.05 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  29.97 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  31.19 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  38.99 
 
 		 267 aa  136  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  31.67 
 
 		 320 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  28.72 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  35.64 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  30.77 
 
 		 314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  30.77 
 
 		 314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  32.73 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  32.84 
 
 		 265 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  30.77 
 
 		 398 aa  129  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  27.68 
 
 		 351 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  27.68 
 
 		 351 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  32.57 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  29.57 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  29.55 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  31.43 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  28.85 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  31.8 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  28.71 
 
 		 317 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  29.13 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  30.45 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  32.2 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  32.2 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  32.2 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  27.39 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  27.69 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  30.41 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  29.47 
 
 		 332 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  31.33 
 
 		 287 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  29.8 
 
 		 331 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  28.24 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  28.62 
 
 		 322 aa  89.4  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  27.63 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  26.8 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  26.8 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  26.65 
 
 		 335 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  26.07 
 
 		 336 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  26.65 
 
 		 345 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  26.65 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  25.84 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  26.65 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  27.46 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  27.08 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  27.15 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  28.33 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  28.02 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  29.63 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  28.9 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  26.67 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  27.57 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  26.34 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  27.06 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  26.3 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  28.25 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  31.61 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  31.61 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  29.68 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  29.55 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  23.53 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10146  conserved hypothetical protein  30.9 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  27.04 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  25.21 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  25.07 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  26.42 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  28.32 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  30.67 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  28.64 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  27.1 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  27.27 
 
 		 215 aa  55.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  27.09 
 
 		 209 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  25.44 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  27.1 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  28.76 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  28.44 
 
 		 249 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  26.22 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  25.63 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  26.27 
 
 		 237 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  26.94 
 
 		 226 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  26.46 
 
 		 372 aa  53.5  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  27.96 
 
 		 201 aa  53.1  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  27.73 
 
 		 340 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  28.37 
 
 		 268 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  26.05 
 
 		 260 aa  53.1  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  28.37 
 
 		 268 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  27.31 
 
 		 267 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  24.07 
 
 		 356 aa  52.8  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  22.54 
 
 		 320 aa  52.8  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  30.73 
 
 		 219 aa  52.8  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  26.64 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>