86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3942 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  718    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  69.8 
 
 
372 aa  495  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  68.86 
 
 
342 aa  471  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  68.29 
 
 
342 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  66.38 
 
 
341 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  62.18 
 
 
350 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  60.4 
 
 
352 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  60.29 
 
 
352 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  61.36 
 
 
353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  57.97 
 
 
362 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  57.97 
 
 
362 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  59.31 
 
 
342 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  58.76 
 
 
354 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  58.4 
 
 
340 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  54.18 
 
 
344 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  56.32 
 
 
348 aa  371  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  54.96 
 
 
345 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  54.49 
 
 
336 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  54.96 
 
 
344 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  54.96 
 
 
335 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  54.49 
 
 
336 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  54.21 
 
 
336 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  54.39 
 
 
335 aa  347  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  57.35 
 
 
340 aa  346  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1251  hypothetical protein  51.87 
 
 
248 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.378284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2226  hypothetical protein  51.87 
 
 
248 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.906086  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0965  hypothetical protein  51.87 
 
 
248 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1948  hypothetical protein  51.87 
 
 
239 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645975  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0143  hypothetical protein  48.3 
 
 
209 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0202764  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0343  hypothetical protein  59.56 
 
 
127 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0377  hypothetical protein  59.56 
 
 
127 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1526  hypothetical protein  59.56 
 
 
127 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1716  hypothetical protein  59.56 
 
 
127 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0106358  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  31.56 
 
 
332 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  31.46 
 
 
332 aa  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  30.03 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  31.67 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  29.28 
 
 
337 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  28.65 
 
 
322 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  31.83 
 
 
329 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  31.83 
 
 
329 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  31.83 
 
 
329 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  28.65 
 
 
343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  31.65 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  31.76 
 
 
321 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  31.49 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  30.03 
 
 
318 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0099  hypothetical protein  29.41 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  27.2 
 
 
320 aa  110  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  27.4 
 
 
317 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  28.82 
 
 
327 aa  105  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01054  conserved hypothetical protein  25.57 
 
 
382 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  29.94 
 
 
344 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  29.58 
 
 
331 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  27.46 
 
 
311 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  31.98 
 
 
287 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  25.28 
 
 
347 aa  85.9  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  29.23 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.505446 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10146  conserved hypothetical protein  24.41 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  24.7 
 
 
320 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  24.56 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  24.23 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  28.57 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  22.82 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  22.82 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  26.2 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  24.71 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4008  hypothetical protein  57.38 
 
 
95 aa  70.5  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281216  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  24.05 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  26.96 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  22.99 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  22.78 
 
 
329 aa  60.5  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  30.23 
 
 
270 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  21.08 
 
 
351 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  22.86 
 
 
321 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  21.08 
 
 
351 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  31.69 
 
 
280 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  30.64 
 
 
342 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  30.23 
 
 
269 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  30.98 
 
 
265 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  24.07 
 
 
335 aa  53.5  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  31.07 
 
 
273 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  26.52 
 
 
215 aa  49.7  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  26.12 
 
 
318 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  30.11 
 
 
267 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  28.82 
 
 
270 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>