31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4008 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4008  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  186  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281216  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  62.71 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  57.58 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  59.32 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  60 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  57.58 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  59.7 
 
 
348 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  56.72 
 
 
342 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  59.32 
 
 
341 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  61.02 
 
 
372 aa  73.9  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  58.33 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0143  hypothetical protein  52.86 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0202764  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  57.38 
 
 
356 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  54.24 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  54.24 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  49.12 
 
 
354 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  57.63 
 
 
340 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  51.67 
 
 
340 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  48.33 
 
 
350 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1948  hypothetical protein  49.18 
 
 
239 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645975  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  49.18 
 
 
335 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  49.18 
 
 
345 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  49.18 
 
 
336 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2226  hypothetical protein  49.18 
 
 
248 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.906086  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1251  hypothetical protein  49.18 
 
 
248 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.378284  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0965  hypothetical protein  49.18 
 
 
248 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  49.18 
 
 
344 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  47.54 
 
 
336 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  45.9 
 
 
336 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  45.9 
 
 
335 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  47.27 
 
 
337 aa  41.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>