81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1722 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
342 aa  697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  60.87 
 
 
348 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  59.31 
 
 
356 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  57.35 
 
 
372 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  60.81 
 
 
342 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  59.08 
 
 
341 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  57.55 
 
 
350 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  56.13 
 
 
352 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  56.23 
 
 
362 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  57.93 
 
 
342 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  56.23 
 
 
362 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  55.27 
 
 
352 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  54.55 
 
 
353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  53.39 
 
 
354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  52.87 
 
 
335 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  51.3 
 
 
344 aa  335  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  52.74 
 
 
336 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  52.87 
 
 
340 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  51.15 
 
 
335 aa  328  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  51.15 
 
 
345 aa  328  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  51.15 
 
 
344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  51.01 
 
 
336 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  51.01 
 
 
336 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  54.07 
 
 
340 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1251  hypothetical protein  48.42 
 
 
248 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.378284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2226  hypothetical protein  48.42 
 
 
248 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.906086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1948  hypothetical protein  48.42 
 
 
239 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645975  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0965  hypothetical protein  48.42 
 
 
248 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0143  hypothetical protein  46.41 
 
 
209 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0202764  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1716  hypothetical protein  52.27 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0106358  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0377  hypothetical protein  52.27 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1526  hypothetical protein  52.27 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0343  hypothetical protein  52.27 
 
 
127 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  29.34 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  28.44 
 
 
320 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  29.43 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  29.43 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  29.43 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01054  conserved hypothetical protein  26.36 
 
 
382 aa  109  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  26.65 
 
 
322 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  27.4 
 
 
332 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  27.97 
 
 
332 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  29.73 
 
 
337 aa  106  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  28.41 
 
 
318 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  28.4 
 
 
317 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  28.69 
 
 
343 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  31.36 
 
 
321 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  28.24 
 
 
320 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  27.86 
 
 
311 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  28.4 
 
 
322 aa  97.1  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  29.52 
 
 
347 aa  96.7  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  27.6 
 
 
327 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  27.81 
 
 
331 aa  89.7  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  28.78 
 
 
307 aa  89.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  29.48 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0099  hypothetical protein  28.05 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  24.33 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  23.7 
 
 
311 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.653188 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10146  conserved hypothetical protein  26.15 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  23.94 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  27.68 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  28.32 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4008  hypothetical protein  56.72 
 
 
95 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281216  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  25.88 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  23.86 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  22.46 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  27.22 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  23.08 
 
 
319 aa  67  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  21.75 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  21.75 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  22.03 
 
 
329 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  25.59 
 
 
269 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  30.06 
 
 
342 aa  53.5  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  23.05 
 
 
321 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  24.25 
 
 
329 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  23.95 
 
 
270 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  28.14 
 
 
265 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  22.25 
 
 
351 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  22.25 
 
 
351 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  23.01 
 
 
335 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  24.7 
 
 
280 aa  46.2  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>