86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4678 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  714    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  74.93 
 
 		 352 aa  541  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  75.28 
 
 		 353 aa  531  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  73.43 
 
 		 350 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  63.99 
 
 		 362 aa  448  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  63.99 
 
 		 362 aa  448  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  61.43 
 
 		 372 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  60.29 
 
 		 356 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  59.54 
 
 		 342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  60.45 
 
 		 348 aa  401  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  58.97 
 
 		 341 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  57.26 
 
 		 342 aa  388  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  56.98 
 
 		 344 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  56.13 
 
 		 342 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  53.65 
 
 		 354 aa  362  7.0000000000000005e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  60.8 
 
 		 340 aa  348  8e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  51.43 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  49.43 
 
 		 336 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  49.15 
 
 		 344 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  48.86 
 
 		 336 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  49.15 
 
 		 335 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  49.15 
 
 		 336 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  49.15 
 
 		 345 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  48.86 
 
 		 335 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0965  hypothetical protein  47.44 
 
 		 248 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2226  hypothetical protein  47.44 
 
 		 248 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.906086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1948  hypothetical protein  47.44 
 
 		 239 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645975  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1251  hypothetical protein  47.44 
 
 		 248 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.378284  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  32.24 
 
 		 329 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  32.24 
 
 		 329 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  32.24 
 
 		 329 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  31.87 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  32.21 
 
 		 332 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01054  conserved hypothetical protein  28.89 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0143  hypothetical protein  46.55 
 
 		 209 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0202764  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  29.74 
 
 		 337 aa  125  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  31.49 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  29.25 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  29.89 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1526  hypothetical protein  51.45 
 
 		 127 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0343  hypothetical protein  51.45 
 
 		 127 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0377  hypothetical protein  51.45 
 
 		 127 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1716  hypothetical protein  51.45 
 
 		 127 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0106358  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  31.49 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  28.99 
 
 		 322 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  30.9 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  30.64 
 
 		 322 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  30.9 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  28.49 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  31.61 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  32.95 
 
 		 344 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  29.86 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  28.65 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  25.84 
 
 		 320 aa  106  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  29.01 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0099  hypothetical protein  28.97 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10146  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 		 326 aa  94.4  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  27.11 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  27.7 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  25.29 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  27.87 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  25.38 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  25.38 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  27.95 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  23.99 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4008  hypothetical protein  60 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281216  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  26.02 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  23.82 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  24.36 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  25.9 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  26.69 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  30.86 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  22.16 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  22.54 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  30.86 
 
 		 270 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  25.84 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  31.18 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  29.63 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  25.29 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  32.62 
 
 		 267 aa  57  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  21.43 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  21.43 
 
 		 351 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  28.93 
 
 		 265 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  29.05 
 
 		 273 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  23.84 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  27.78 
 
 		 270 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>