187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2775 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2775  cyclase  100 
 
 		 329 aa  678    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  62.46 
 
 		 335 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  58.39 
 
 		 329 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  50 
 
 		 308 aa  309  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  41.74 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  36 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  39.3 
 
 		 280 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  30 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  30 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  33.11 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  31.15 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  29.82 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  29.82 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  34.85 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  36.21 
 
 		 269 aa  139  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  28.33 
 
 		 311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  30.43 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  30.56 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  29.67 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  32.23 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  29.32 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  28.17 
 
 		 351 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  28.17 
 
 		 351 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  30.26 
 
 		 318 aa  116  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  29.76 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  30.43 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  35.78 
 
 		 270 aa  108  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  29.32 
 
 		 327 aa  106  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  31.48 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  28.48 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  28.66 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  30.57 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  30.63 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  29.81 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  25.78 
 
 		 322 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  30.03 
 
 		 329 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  30.03 
 
 		 329 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  30.03 
 
 		 329 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  26.05 
 
 		 320 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  27.57 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  27.16 
 
 		 320 aa  92.4  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  28.06 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  26.45 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  30.07 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  27.54 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  29.86 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  26.69 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  31.88 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  29.95 
 
 		 223 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  26.2 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  27.13 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  25.99 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  26.69 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  27.61 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  25.08 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  29.17 
 
 		 210 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  25.51 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  24.46 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  26.06 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  27.31 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  25.83 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  25.83 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  25.59 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  24.49 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  26.79 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  26.29 
 
 		 215 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  29.7 
 
 		 219 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  26.34 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  26.16 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  28.07 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  27.8 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  25.75 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  25.58 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  28.02 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  27.59 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  26.05 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  26.75 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  24.89 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  23.53 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  24.23 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  25.86 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  24.17 
 
 		 257 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  26.07 
 
 		 215 aa  57  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  27.65 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  26.42 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  27.54 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01054  conserved hypothetical protein  24.04 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  27.83 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  24.88 
 
 		 204 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  26.03 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  23.77 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  26.42 
 
 		 262 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  25.65 
 
 		 347 aa  53.1  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  23.85 
 
 		 336 aa  53.1  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  26.42 
 
 		 210 aa  52.8  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  24.77 
 
 		 270 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  24 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  24.25 
 
 		 342 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  29.23 
 
 		 205 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  24.23 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>