231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2003 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  100 
 
 
222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  35.43 
 
 
205 aa  98.6  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  34.13 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  31.82 
 
 
220 aa  96.7  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  31.63 
 
 
212 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  35.5 
 
 
205 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  29.91 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  29.91 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  29.91 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  31.22 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  29.91 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  29.91 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  33.16 
 
 
249 aa  89.7  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  30.41 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  32.86 
 
 
215 aa  89.7  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  29.91 
 
 
210 aa  89  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  27.07 
 
 
213 aa  89  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  29.77 
 
 
210 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  29.44 
 
 
210 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  33 
 
 
253 aa  87.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  33.71 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  35.09 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  29.3 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  32.26 
 
 
217 aa  84  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  34.68 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  28.84 
 
 
210 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  26.97 
 
 
280 aa  84  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  32.26 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  25.63 
 
 
223 aa  82  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  31.07 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  31 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  32.02 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  32.02 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  29.02 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  31.96 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  25.42 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  29.14 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  32.02 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  27.18 
 
 
205 aa  79  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  32.96 
 
 
203 aa  79  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  31.67 
 
 
237 aa  78.2  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  27.57 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  29.03 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  26.78 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  30.77 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  32.31 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  28.18 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  25 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  29.86 
 
 
257 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  28.1 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  30.36 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  32.74 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  29.46 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  28.45 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  26.94 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  33.17 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  31.88 
 
 
329 aa  72.4  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  25.97 
 
 
265 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  29.48 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  31.58 
 
 
287 aa  71.6  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  26.5 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  30.57 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3386  cyclase family protein  28.51 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  27.27 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  33.53 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2549  cyclase family protein  33.9 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.564227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  27.5 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  25.11 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  29.15 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  28.93 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  31.46 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  31.79 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  30.46 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  31.07 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  29.28 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1500  cyclase family protein  28.7 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.256572  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  32.32 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  31.07 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  30.77 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  30.35 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1511  putative cyclase  28.44 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3685  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  30.2 
 
 
270 aa  68.2  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  31.19 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  31.21 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  29.24 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  25.11 
 
 
275 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  30.12 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  30.12 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  32.71 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  28.28 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  28.84 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  28.21 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  30.12 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  29.41 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  26.98 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  28.57 
 
 
283 aa  65.5  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  25.4 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  29.72 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  29.08 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  29.53 
 
 
264 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>