225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3771 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  100 
 
 
233 aa  481  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  98.71 
 
 
233 aa  478  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  86.96 
 
 
231 aa  425  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  32.07 
 
 
220 aa  116  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  29.02 
 
 
210 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  35.48 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  31.12 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  29.52 
 
 
210 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  29.2 
 
 
213 aa  90.1  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  33.19 
 
 
213 aa  88.2  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  31.1 
 
 
258 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  33.33 
 
 
254 aa  85.9  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  29.89 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  28.94 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  29.12 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  29.62 
 
 
259 aa  82  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  28.94 
 
 
253 aa  81.6  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  32.5 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  27.69 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  32.02 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  27.87 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  29.17 
 
 
267 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  31.22 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  29.79 
 
 
295 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  29.74 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  30.81 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  34.52 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  31.91 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  31.32 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  29.5 
 
 
260 aa  75.1  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  31.46 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  31.15 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  26.79 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  31.69 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  34.43 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  31.16 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  26.04 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  27.03 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1511  putative cyclase  27.51 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3685  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  26.44 
 
 
271 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  29.41 
 
 
253 aa  71.6  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  28.2 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  27.12 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  28.45 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  26.46 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  30.47 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  28.65 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  29.06 
 
 
216 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  28.38 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  26.43 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  26.32 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  27.41 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  29.19 
 
 
272 aa  67  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  30.77 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  32.2 
 
 
268 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  31.43 
 
 
226 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  31.9 
 
 
262 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  27.18 
 
 
268 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  27.34 
 
 
308 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  28.45 
 
 
237 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  26.5 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  25.33 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  31.07 
 
 
226 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  26.69 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  26.84 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  26.69 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  27.08 
 
 
205 aa  63.5  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  29.06 
 
 
217 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  23.14 
 
 
216 aa  63.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  31.28 
 
 
275 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  24.12 
 
 
216 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  25.19 
 
 
266 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  27.04 
 
 
209 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  30.48 
 
 
226 aa  62.4  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  26.77 
 
 
209 aa  62.4  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  26.29 
 
 
222 aa  62.4  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  27.59 
 
 
227 aa  62  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  25.78 
 
 
253 aa  62  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  26.36 
 
 
262 aa  61.6  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  27.35 
 
 
219 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  25.51 
 
 
209 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  27.92 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  25.85 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  27.04 
 
 
209 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  26.26 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2549  cyclase family protein  28.05 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.564227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  31.28 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  27.16 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  28.11 
 
 
201 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  28.34 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  28.33 
 
 
215 aa  60.1  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  28.39 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  26.53 
 
 
209 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  27.75 
 
 
209 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  25.29 
 
 
214 aa  60.1  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  28.65 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  29.55 
 
 
259 aa  59.3  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  29.48 
 
 
260 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  27.55 
 
 
277 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  26.05 
 
 
210 aa  58.9  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>