271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1761 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  100 
 
 
213 aa  427  1e-119  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  37.56 
 
 
220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  33.02 
 
 
215 aa  141  9e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  35.38 
 
 
208 aa  138  6e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  34.45 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  32.09 
 
 
201 aa  128  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  33.33 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  35.38 
 
 
210 aa  125  5e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  33.96 
 
 
210 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  33.96 
 
 
210 aa  125  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  33.96 
 
 
210 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  33.96 
 
 
210 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  36.15 
 
 
209 aa  124  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  33.49 
 
 
210 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  30.8 
 
 
237 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  33.49 
 
 
210 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  33.96 
 
 
213 aa  123  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  32.24 
 
 
214 aa  122  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  33.02 
 
 
210 aa  121  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  33.02 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  33.02 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  33.02 
 
 
210 aa  118  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  32.23 
 
 
210 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  29.73 
 
 
275 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  32.27 
 
 
377 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  31.9 
 
 
216 aa  116  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  31.13 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  31.75 
 
 
217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  34.43 
 
 
226 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  37.27 
 
 
215 aa  114  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  28.33 
 
 
249 aa  114  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  34.91 
 
 
226 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  33.5 
 
 
280 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  32.27 
 
 
219 aa  112  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  33.17 
 
 
210 aa  112  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  30.95 
 
 
216 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  33.49 
 
 
207 aa  111  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  28.96 
 
 
275 aa  111  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  33.18 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  28.44 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  33.96 
 
 
211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  33.18 
 
 
214 aa  109  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  30.48 
 
 
217 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  32.76 
 
 
238 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  31.48 
 
 
217 aa  108  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  29.77 
 
 
214 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  31.96 
 
 
222 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  32.77 
 
 
260 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  28.3 
 
 
220 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  32.87 
 
 
227 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  29.09 
 
 
237 aa  104  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  32.06 
 
 
205 aa  104  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  32.55 
 
 
209 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  28.94 
 
 
264 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  31.43 
 
 
213 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  32.54 
 
 
209 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  33.49 
 
 
209 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  27.4 
 
 
269 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  33.01 
 
 
209 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  33.01 
 
 
209 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  27.4 
 
 
272 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  27.4 
 
 
272 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  28.09 
 
 
259 aa  101  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  32.54 
 
 
209 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  32.86 
 
 
209 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  30.45 
 
 
295 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  32.06 
 
 
209 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  32.89 
 
 
215 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  31.6 
 
 
210 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  29.28 
 
 
261 aa  99.8  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  31.22 
 
 
280 aa  99.4  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  28.11 
 
 
223 aa  99  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  32.23 
 
 
209 aa  98.6  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  32.23 
 
 
209 aa  98.6  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  25.68 
 
 
284 aa  98.6  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  28.18 
 
 
216 aa  98.6  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  27.01 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  30.99 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  31.78 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  30.23 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  29.79 
 
 
268 aa  97.1  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  29.19 
 
 
209 aa  95.9  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  31.16 
 
 
228 aa  95.9  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  27.03 
 
 
273 aa  95.1  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  30.28 
 
 
219 aa  94.7  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  30.37 
 
 
213 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  30.37 
 
 
213 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  28.77 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  32.55 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  27.38 
 
 
277 aa  92.8  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37590  kynurenine formamidase, KynB  29.19 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  33.17 
 
 
205 aa  92.8  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  25.11 
 
 
268 aa  92.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  25.96 
 
 
209 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  28.23 
 
 
213 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  27.81 
 
 
278 aa  92  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0710  arylformamidase  28.37 
 
 
209 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  30.88 
 
 
294 aa  92  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  29.22 
 
 
237 aa  91.7  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  27.75 
 
 
212 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>