248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2761 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  100 
 
 
216 aa  443  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  43.78 
 
 
377 aa  160  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  41.2 
 
 
216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  40.38 
 
 
214 aa  142  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  40.38 
 
 
217 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  41.23 
 
 
216 aa  141  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  36.36 
 
 
212 aa  135  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  37.67 
 
 
222 aa  132  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  34.45 
 
 
219 aa  131  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  41.35 
 
 
207 aa  131  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  37.74 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  37.98 
 
 
201 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  42.42 
 
 
193 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  33.33 
 
 
213 aa  125  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  33.49 
 
 
210 aa  123  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  33.17 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  36.19 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  33.99 
 
 
217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  33.49 
 
 
210 aa  116  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  34.11 
 
 
217 aa  114  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  29.49 
 
 
216 aa  114  8.999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  32.39 
 
 
214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  34.76 
 
 
220 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  36.99 
 
 
229 aa  108  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  30.74 
 
 
238 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  31.43 
 
 
237 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  30.14 
 
 
213 aa  106  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  33.02 
 
 
215 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  30.52 
 
 
209 aa  105  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  31.8 
 
 
211 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  32.55 
 
 
226 aa  104  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  35.43 
 
 
224 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  32.08 
 
 
226 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  28.71 
 
 
221 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  29.19 
 
 
210 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  31.31 
 
 
210 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  32.86 
 
 
213 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  30.14 
 
 
223 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  28.71 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  28.23 
 
 
210 aa  99  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  29.58 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  28.71 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  28.71 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  28.71 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  28.71 
 
 
210 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  28.71 
 
 
210 aa  98.2  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  28.71 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  32.55 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  33.33 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  29.86 
 
 
210 aa  94.7  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  32.56 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  33.63 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  33.33 
 
 
212 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  30.84 
 
 
220 aa  92.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  33.18 
 
 
255 aa  92.8  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  33.33 
 
 
242 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  33.33 
 
 
213 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  33.33 
 
 
213 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  33.33 
 
 
213 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  33.33 
 
 
213 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  29.07 
 
 
237 aa  91.7  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  30.77 
 
 
215 aa  91.7  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  33.18 
 
 
242 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  33.18 
 
 
242 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0915  cyclase family protein  28.25 
 
 
224 aa  90.5  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0937  cyclase family protein  28.25 
 
 
224 aa  90.5  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  29.72 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  30.18 
 
 
265 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  29.86 
 
 
204 aa  89  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  27.1 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  31.43 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  30.95 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  27.27 
 
 
205 aa  87  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  32.38 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  32.38 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  28.44 
 
 
284 aa  86.3  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  30.81 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0508  arylformamidase  34.29 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24803  normal  0.0492636 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  32.38 
 
 
213 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  29.03 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  33.64 
 
 
218 aa  85.9  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  27.23 
 
 
209 aa  85.5  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  28.11 
 
 
209 aa  85.1  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  28.11 
 
 
209 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  34.12 
 
 
200 aa  85.1  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  30.95 
 
 
213 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  30 
 
 
226 aa  84.7  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  31.58 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  28.11 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  28.11 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2165  arylformamidase  32.39 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267222  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  28.11 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  29.15 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  28.76 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1449  arylformamidase  32.86 
 
 
217 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  28.57 
 
 
209 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  28.11 
 
 
209 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0710  arylformamidase  31.1 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  31.28 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  27.65 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>