230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4034 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  100 
 
 		 377 aa  729    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  64.38 
 
 		 216 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  58.45 
 
 		 214 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  43.78 
 
 		 216 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  42.86 
 
 		 217 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  42.86 
 
 		 213 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  41.63 
 
 		 222 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  44.09 
 
 		 216 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  37.95 
 
 		 219 aa  127  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  44.02 
 
 		 193 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  40.71 
 
 		 224 aa  126  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  37.78 
 
 		 220 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  37.28 
 
 		 215 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  38.64 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  32.27 
 
 		 213 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  34.39 
 
 		 212 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  36.65 
 
 		 201 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  34.98 
 
 		 226 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  32.74 
 
 		 215 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  36.53 
 
 		 214 aa  109  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  33.63 
 
 		 226 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  29.65 
 
 		 221 aa  109  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  34.52 
 
 		 227 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  34.23 
 
 		 237 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  35.65 
 
 		 226 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  35.68 
 
 		 217 aa  102  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  35 
 
 		 213 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  32.58 
 
 		 219 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  29.46 
 
 		 210 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  29.46 
 
 		 210 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  30 
 
 		 210 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  29.46 
 
 		 210 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  29.46 
 
 		 210 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  29.46 
 
 		 210 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  28.96 
 
 		 210 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  28.82 
 
 		 205 aa  98.2  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  37.16 
 
 		 207 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  34.75 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  28.82 
 
 		 210 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  32.88 
 
 		 210 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  28.96 
 
 		 210 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  33.94 
 
 		 210 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  29.09 
 
 		 216 aa  97.1  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  29.02 
 
 		 210 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  33.77 
 
 		 217 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  30.54 
 
 		 238 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  29.41 
 
 		 214 aa  93.6  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  32.74 
 
 		 209 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  32.74 
 
 		 209 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  32.29 
 
 		 209 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  31.36 
 
 		 215 aa  90.9  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  32.74 
 
 		 209 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  32.29 
 
 		 209 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  33.48 
 
 		 222 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  29.91 
 
 		 228 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  34.38 
 
 		 208 aa  89  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  31.39 
 
 		 209 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  31.84 
 
 		 209 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  33.9 
 
 		 237 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  28.77 
 
 		 209 aa  87.8  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  31.72 
 
 		 209 aa  87  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  31.39 
 
 		 209 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  31.39 
 
 		 209 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  34.12 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  30.49 
 
 		 209 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  32.11 
 
 		 220 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  32.88 
 
 		 213 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  35.06 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  31.56 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  31.44 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  25.88 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  31.02 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1127  cyclase family protein  26.01 
 
 		 189 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1550  cyclase family protein  25.11 
 
 		 189 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  30.32 
 
 		 205 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  34.25 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  33.91 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0824  cyclase family protein  25.11 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.924773  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  29.82 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  33.04 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  30.18 
 
 		 205 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  30.91 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  30.91 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  28.31 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  27.95 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  34.7 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  30.36 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2549  cyclase family protein  33.04 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.564227 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2438  arylformamidase  32.89 
 
 		 223 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  28.83 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  34.3 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  27.2 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  31.67 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1449  arylformamidase  31.25 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  30.64 
 
 		 211 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  31.98 
 
 		 218 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  32.83 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1500  cyclase family protein  33.01 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.256572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  24.75 
 
 		 272 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  30.49 
 
 		 213 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>