250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1973 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  54.74 
 
 		 280 aa  299  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  44.92 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  40.75 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  43.48 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  39.3 
 
 		 237 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  37.61 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  38.2 
 
 		 275 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  39.73 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  40.37 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  37.34 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  39.55 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  39.55 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  37.74 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  35.48 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  39.15 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  37.16 
 
 		 259 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  35.09 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  38.77 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  38.29 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  37.33 
 
 		 259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  34.96 
 
 		 260 aa  136  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  33.74 
 
 		 257 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  36.58 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  38.64 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  37.66 
 
 		 270 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  41.49 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  35.71 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  35.05 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  39.6 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  34.12 
 
 		 249 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  37.74 
 
 		 260 aa  125  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  34.95 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  34.95 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  35.38 
 
 		 259 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  32.68 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  34.56 
 
 		 268 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  34.8 
 
 		 249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  33.5 
 
 		 213 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  37.56 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  31.09 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  33.17 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  32.12 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  29.41 
 
 		 287 aa  108  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  30.89 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  31.67 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  28.4 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  36.76 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  32.67 
 
 		 247 aa  103  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  31.25 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  32.67 
 
 		 243 aa  102  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  33.09 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  28 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  31.19 
 
 		 244 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  30.96 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  29.96 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  34.04 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  35.83 
 
 		 230 aa  99.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  31.73 
 
 		 306 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  32.77 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  31.67 
 
 		 220 aa  97.8  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  31.22 
 
 		 216 aa  91.7  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  29.76 
 
 		 244 aa  91.3  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0077  cyclase family protein  30.29 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  33.33 
 
 		 210 aa  90.5  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  34.8 
 
 		 210 aa  89.7  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  28.21 
 
 		 210 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  28.21 
 
 		 210 aa  89  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  28.21 
 
 		 210 aa  89  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  29.71 
 
 		 212 aa  89  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  28.21 
 
 		 210 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  28.21 
 
 		 210 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  28.21 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  29.66 
 
 		 219 aa  88.6  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  27.78 
 
 		 210 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  28.21 
 
 		 210 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  28.63 
 
 		 210 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  34.8 
 
 		 208 aa  86.3  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  33.51 
 
 		 264 aa  85.9  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  28.09 
 
 		 210 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  26.97 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  29.83 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  26.2 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  32.5 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  29.08 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  33.33 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  32.5 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  33.33 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  24.26 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  32.16 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  30.1 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  28.27 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  29.95 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  31.12 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  30.21 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  33.02 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  30.5 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  26.81 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  27.63 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  28.64 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>