197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2646 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  100 
 
 		 270 aa  533  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  45.88 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  43.75 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  43.97 
 
 		 266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  45.24 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  43.75 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  42.17 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  42.17 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  42.97 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  42.02 
 
 		 260 aa  204  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  42.25 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  45.85 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  42.19 
 
 		 275 aa  201  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  42.31 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  42.91 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  40.16 
 
 		 261 aa  200  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  40 
 
 		 262 aa  198  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  41.18 
 
 		 258 aa  198  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  40.08 
 
 		 255 aa  199  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  43.14 
 
 		 287 aa  198  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  43.65 
 
 		 260 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  42.97 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  42.97 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  43.7 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  43.87 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  41.02 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  40.62 
 
 		 268 aa  188  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  39.06 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  40.55 
 
 		 253 aa  181  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  38.98 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  35.97 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  33.62 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  29.5 
 
 		 212 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  33.04 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  24.24 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  32.02 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  29.02 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  29.54 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  34.57 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  30.47 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  27.14 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  24.6 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  29.01 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  28.57 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  30.57 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  31.5 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  30.47 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  35 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  31.34 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  30.73 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  31.19 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  30.86 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  35.57 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  30.09 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  28.99 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  32.81 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  27.68 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  24.35 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  29.3 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  26.55 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  29.33 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  28.43 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  29.19 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  29.37 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  33.33 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  30.57 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  26.98 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  28.11 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  26.85 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  26.85 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  26.98 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  27.08 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  26.84 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  26.84 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  26.84 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  26.84 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  26.84 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  27.89 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  26.13 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  27.84 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  30.89 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  26.46 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  28.57 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  29.85 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  31.71 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  33.88 
 
 		 216 aa  62  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  23.29 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  26.46 
 
 		 210 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  25.93 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  26.39 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  27.62 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  29.24 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  26.11 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  35.38 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  24.46 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  27.6 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  28.72 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  28.49 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  28.72 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  31.44 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>