119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2398 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  100 
 
 		 263 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  72.73 
 
 		 260 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  67.45 
 
 		 262 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  63.04 
 
 		 260 aa  338  5.9999999999999996e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  62.45 
 
 		 258 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  61.18 
 
 		 262 aa  332  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  60.77 
 
 		 271 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  61.18 
 
 		 260 aa  328  4e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  60.7 
 
 		 268 aa  328  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  60.7 
 
 		 275 aa  328  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  60.7 
 
 		 268 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  60.7 
 
 		 268 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  59.45 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  59.38 
 
 		 259 aa  322  6e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  57.59 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  59.61 
 
 		 260 aa  314  7e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  58.75 
 
 		 266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  59.38 
 
 		 267 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  59.53 
 
 		 262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  56.25 
 
 		 258 aa  304  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  54.12 
 
 		 261 aa  281  9e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  46.36 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  45.14 
 
 		 287 aa  209  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  43.8 
 
 		 255 aa  208  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  44.75 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  44.31 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  43.7 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  42.31 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  44.36 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  40.39 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  39.92 
 
 		 253 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  40.31 
 
 		 236 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  30.15 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  29.67 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  30.65 
 
 		 220 aa  62  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  28.26 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  29.67 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  28.84 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  27.5 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  26.74 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  27.5 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  26.63 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  26.63 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  26.5 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  28.57 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  27.5 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  26.63 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  26.63 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  26.63 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  22.77 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  24.42 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  27.72 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  26.24 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  27.06 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  26.5 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  31.19 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0414  cyclase family protein  25.32 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  26.46 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  24.53 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  29.7 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  28.65 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  26.34 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  28.12 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  23.58 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  29.17 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  28.32 
 
 		 277 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  35.66 
 
 		 217 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  27.92 
 
 		 216 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  26.94 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  23.36 
 
 		 226 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  30 
 
 		 210 aa  49.3  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  28.11 
 
 		 276 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  29.44 
 
 		 231 aa  48.9  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  25.5 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  27.78 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  28.86 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  26.15 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  28.85 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  26.04 
 
 		 205 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  24.14 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  24.1 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  27.19 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  22.9 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  29.53 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  31.72 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  25.57 
 
 		 270 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  28.95 
 
 		 213 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  28.95 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  27.23 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  27.57 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  25.74 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  26.63 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  26.99 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  24.34 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  22.86 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  26.29 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  30.15 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  27.32 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  25.41 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  27.65 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>