114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3149 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  100 
 
 		 259 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  76.36 
 
 		 259 aa  424  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  71.15 
 
 		 271 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  71.32 
 
 		 262 aa  386  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  68.32 
 
 		 275 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  68.7 
 
 		 268 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  68.73 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  68.32 
 
 		 268 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  68.32 
 
 		 268 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  66.79 
 
 		 268 aa  368  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  66.79 
 
 		 267 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  63.98 
 
 		 266 aa  348  6e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  60.85 
 
 		 260 aa  342  5e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  59.85 
 
 		 260 aa  333  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  59.3 
 
 		 261 aa  331  8e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  60 
 
 		 262 aa  328  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  59.45 
 
 		 263 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  59.77 
 
 		 260 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  59.92 
 
 		 260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  60.87 
 
 		 258 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  60.16 
 
 		 262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  46.69 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  45.91 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  44.36 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  41.86 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  41.63 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  42.91 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  40.78 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  41.83 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  43.46 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  38.67 
 
 		 253 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  40.69 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  29.23 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  29.62 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  28.63 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  25.48 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  30.73 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  26.87 
 
 		 210 aa  62  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  29.74 
 
 		 217 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  27.05 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  26.47 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  24.06 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  28.57 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  30.85 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  25.11 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  27.07 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  28.38 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  28.12 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  29.85 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  23.12 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  28.23 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  25.1 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  22.68 
 
 		 226 aa  52.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  26.73 
 
 		 227 aa  52.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  26.4 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  30.46 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  27.45 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  27.51 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  25.98 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  27.45 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  30.61 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  32.62 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  22.22 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  27.06 
 
 		 280 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  31.62 
 
 		 320 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  25.85 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  25.22 
 
 		 269 aa  48.9  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  25.97 
 
 		 290 aa  48.9  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  23.62 
 
 		 215 aa  48.9  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  25.62 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  26.29 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  24.42 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  27.23 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  28.11 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  28.11 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  30.92 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  24.52 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  24.52 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  27.64 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  29.9 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  25.25 
 
 		 216 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  31.45 
 
 		 216 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  28.5 
 
 		 201 aa  46.2  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  24.66 
 
 		 243 aa  46.2  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  26.15 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  28.8 
 
 		 209 aa  46.2  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  25.93 
 
 		 335 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  24.8 
 
 		 209 aa  45.8  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  28.51 
 
 		 277 aa  45.8  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  29.06 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  26.05 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  29.06 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  27.33 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  25.78 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  27.62 
 
 		 200 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  29.13 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  31.78 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  21.21 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  26.04 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  21.72 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>