132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3414 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  100 
 
 		 262 aa  540  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  75.57 
 
 		 268 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  73.28 
 
 		 267 aa  407  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  73.66 
 
 		 275 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  73.28 
 
 		 268 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  73.15 
 
 		 258 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  72.9 
 
 		 268 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  72.9 
 
 		 268 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  71.76 
 
 		 271 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  71.32 
 
 		 259 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  67.69 
 
 		 266 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  68.73 
 
 		 259 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  65.89 
 
 		 260 aa  363  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  62.79 
 
 		 260 aa  355  5e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  63.92 
 
 		 260 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  62.85 
 
 		 262 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  60.7 
 
 		 260 aa  338  4e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  59.69 
 
 		 261 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  61.18 
 
 		 263 aa  332  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  58.04 
 
 		 258 aa  318  7.999999999999999e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  58.2 
 
 		 262 aa  308  5e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  46.27 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  45.53 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  44.36 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  44.79 
 
 		 283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  42.25 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  42.47 
 
 		 287 aa  201  9e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  42.31 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  40.62 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  38.43 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  36.58 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  37.39 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  27.31 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  27.69 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  28.52 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  26.61 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  28.69 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  23 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  27.23 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  25.26 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  27.94 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  28.79 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  24.19 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  26.78 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  28.86 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  24.66 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  29.18 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  23.72 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  27.65 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  29.44 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  26.13 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  24.42 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  24.03 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  24.03 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  24.03 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  24.03 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  24.03 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  23.56 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  23.62 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  23.62 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  24.03 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  24.89 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  29.41 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  27.8 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  24.52 
 
 		 203 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  26.27 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  26.4 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  26.85 
 
 		 280 aa  52.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  28.88 
 
 		 275 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  26.7 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  23.26 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  26.64 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  23.9 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  27.14 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  25.49 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  25.78 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  28.08 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  23.72 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  25.83 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  28.57 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  21.37 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  26.17 
 
 		 270 aa  48.5  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1511  putative cyclase  23.05 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3685  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  26.17 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  26.17 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  27.4 
 
 		 377 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  25.37 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  28.5 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  26.44 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  23.76 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  23.87 
 
 		 329 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  26.71 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  26.79 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  27.21 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  26.85 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  23.89 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  23.81 
 
 		 287 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  25.97 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  27.05 
 
 		 207 aa  45.8  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  23.44 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>