127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7460 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  100 
 
 		 275 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  90.3 
 
 		 268 aa  510  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  90.3 
 
 		 268 aa  510  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  84.96 
 
 		 267 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  78.36 
 
 		 268 aa  451  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  77.61 
 
 		 268 aa  450  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  73.66 
 
 		 262 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  74.33 
 
 		 271 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  70.5 
 
 		 258 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  69.08 
 
 		 266 aa  381  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  68.32 
 
 		 259 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  68.06 
 
 		 259 aa  368  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  65.12 
 
 		 260 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  64.5 
 
 		 260 aa  359  3e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  62.31 
 
 		 260 aa  348  6e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  60.31 
 
 		 261 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  60.77 
 
 		 260 aa  334  9e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  60.7 
 
 		 263 aa  328  7e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  57.2 
 
 		 262 aa  319  3e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  59.07 
 
 		 262 aa  318  3.9999999999999996e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  56.92 
 
 		 258 aa  318  7e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  44.54 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  44.12 
 
 		 253 aa  208  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  42.47 
 
 		 253 aa  205  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  42.19 
 
 		 270 aa  201  9e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  40.68 
 
 		 283 aa  195  5.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  42.75 
 
 		 255 aa  195  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  41.31 
 
 		 262 aa  191  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  40.76 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  37.45 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  36.78 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  37.55 
 
 		 236 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  27.82 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  28.2 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  25.87 
 
 		 231 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  25.87 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  33.57 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  28.37 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  25 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  24.64 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  25.87 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  25.12 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  29.76 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  27.72 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  27.17 
 
 		 258 aa  57  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  23.04 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  28.64 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  25.78 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  25.73 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  25.19 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  25 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  29.72 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  27.97 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  25.78 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  25.77 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  25.77 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  25.77 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  25.77 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  28.02 
 
 		 220 aa  54.7  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  25.77 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  26.15 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  24.37 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  27.57 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  27.57 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  24.62 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  26.15 
 
 		 210 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  27.97 
 
 		 275 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  25.38 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  26.42 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  26.26 
 
 		 216 aa  52.4  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  25.93 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  25.93 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  22.87 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  31.65 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  26.42 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  24.32 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  26.47 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  24.32 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  25.93 
 
 		 377 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  25.44 
 
 		 291 aa  49.3  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  28.92 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  27.72 
 
 		 201 aa  49.3  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  25.84 
 
 		 268 aa  49.3  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  25.55 
 
 		 219 aa  48.9  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  29.55 
 
 		 278 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  25 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  25.12 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  25.89 
 
 		 329 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  32.39 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  25.12 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  23.6 
 
 		 209 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  25.09 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  25.48 
 
 		 219 aa  46.2  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  26.14 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  24.12 
 
 		 226 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  28.4 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  25.48 
 
 		 218 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  24.89 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  25.37 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  25.36 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>