218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3004 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  100 
 
 		 237 aa  471  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3221  cyclase family protein  84.43 
 
 		 216 aa  289  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  59.91 
 
 		 218 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  58.64 
 
 		 222 aa  249  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  60 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1511  putative cyclase  57.27 
 
 		 217 aa  242  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3685  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  55.05 
 
 		 219 aa  239  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  51.38 
 
 		 295 aa  218  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1500  cyclase family protein  55.31 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.256572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  48.92 
 
 		 294 aa  214  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  46.05 
 
 		 228 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2549  cyclase family protein  50.23 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.564227 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  36.04 
 
 		 215 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  29.86 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  33.2 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  33.04 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  33.49 
 
 		 213 aa  95.5  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  30.77 
 
 		 212 aa  95.1  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  32.27 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  32.27 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  33.63 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  25.79 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  29.22 
 
 		 213 aa  91.7  9e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  27.98 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  33.9 
 
 		 377 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  32.14 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  27.98 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  30.84 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  27.52 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  27.52 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  32.89 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  27.98 
 
 		 210 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  27.52 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  27.52 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  27.52 
 
 		 210 aa  85.9  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  27.52 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  31.05 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  27.52 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  36.32 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  35.22 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  33.93 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  30.28 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  32.29 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  26.94 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  29.39 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  31.67 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  28.11 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  27.91 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  29.18 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  27.65 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  27.65 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  35.23 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  25.45 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  27.19 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  27.19 
 
 		 209 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  25.44 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  27.78 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  30.91 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  32.54 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  27.19 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  26.07 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  30.97 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  26.73 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  28.25 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  28.63 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  29.87 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  29.01 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  29.87 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  27.19 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  27.19 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  26.73 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  28.5 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  28.16 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  25.45 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  39.34 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  28.86 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  31.96 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  25.11 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  31.25 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  25.89 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  31.37 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  30.91 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  26.54 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  28.36 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  30.29 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  31.75 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  28.45 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  37.34 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  28.45 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  29.46 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  28.74 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  27.71 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  29.13 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  33.19 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  27.7 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  29.91 
 
 		 200 aa  62  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  25.46 
 
 		 208 aa  62  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  25.46 
 
 		 208 aa  62  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  28.21 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>