112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0387 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  100 
 
 		 268 aa  558  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  89.93 
 
 		 268 aa  513  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  77.61 
 
 		 275 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  77.15 
 
 		 267 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  76.49 
 
 		 268 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  76.49 
 
 		 268 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  72.93 
 
 		 271 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  73.28 
 
 		 262 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  70.5 
 
 		 258 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  68.7 
 
 		 266 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  67.3 
 
 		 259 aa  373  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  64.89 
 
 		 260 aa  371  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  66.79 
 
 		 259 aa  368  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  64.75 
 
 		 260 aa  362  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  61.92 
 
 		 260 aa  343  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  61 
 
 		 260 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  58.4 
 
 		 262 aa  338  7e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  60.62 
 
 		 262 aa  325  6e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  57.59 
 
 		 263 aa  317  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  55.77 
 
 		 258 aa  308  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  54.2 
 
 		 261 aa  300  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  46.36 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  45.98 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  44.4 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  41.06 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  40.61 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  39.92 
 
 		 262 aa  191  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  41.02 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  39.02 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  36.78 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  37.02 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  37.8 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  26.79 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  26.42 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  25.48 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  28.16 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  27.97 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  24.02 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  26.87 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  30.8 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  26.82 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  27.18 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  27.12 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  24.43 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  26.34 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  27.23 
 
 		 377 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  28.96 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  28.86 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  26.18 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  24.36 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  24.36 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  22.97 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  24.36 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  24.36 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  27.05 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  27.95 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  25.58 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  24.36 
 
 		 210 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  24.36 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  24.36 
 
 		 210 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  25.12 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  31.13 
 
 		 280 aa  53.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  24.36 
 
 		 210 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  24.31 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  26.48 
 
 		 258 aa  52.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  27.85 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  25 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  23.93 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  24.36 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  26.34 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  27.59 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  22.01 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  30 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  26.84 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  27.37 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  23.92 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  26.96 
 
 		 219 aa  50.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  23 
 
 		 216 aa  49.7  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  27.65 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  25.36 
 
 		 215 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  25.35 
 
 		 272 aa  48.9  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  24.64 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  25.29 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  29.33 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  24.23 
 
 		 209 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  25.14 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  24.66 
 
 		 215 aa  47  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  26.5 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  25.4 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  25.22 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  25.81 
 
 		 205 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  25.71 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  29.63 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  29.76 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  25 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  23.41 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  23.25 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  25 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  28.77 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  24.78 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>