231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1870 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  100 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  36.49 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  36.62 
 
 		 212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  36.15 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  34.91 
 
 		 220 aa  122  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  36.99 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  32.26 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  32.72 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  35.78 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  34.11 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  31.8 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  32.11 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  32.11 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  31.34 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  32.11 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  31.34 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  31.65 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  31.65 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  31.48 
 
 		 213 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  33.03 
 
 		 223 aa  107  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  38.36 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  35.48 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  30.88 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  36.94 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  31.46 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  38.55 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  30.87 
 
 		 238 aa  98.6  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  30.09 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  34.74 
 
 		 217 aa  98.6  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  34.38 
 
 		 377 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  33.64 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  31.43 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  35.4 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  31.75 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  33.18 
 
 		 220 aa  91.3  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  31.28 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  34.39 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  34.58 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  30.43 
 
 		 295 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1500  cyclase family protein  31.44 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.256572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  30.22 
 
 		 294 aa  89.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  29.73 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  28.44 
 
 		 219 aa  88.6  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  31.14 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  30.99 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  33.65 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  32.14 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  32.11 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  30.84 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  28.7 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1511  putative cyclase  28.32 
 
 		 217 aa  84.7  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3685  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  28.97 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  32.26 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  31.05 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0937  cyclase family protein  28.63 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0915  cyclase family protein  28.63 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  30.37 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  29.96 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  28.64 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  29.25 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  31.71 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  30.28 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  30.28 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  34.16 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  30.37 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  32.74 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  33.05 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  30.96 
 
 		 280 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3386  cyclase family protein  29.82 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  29.75 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  28.69 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  31.93 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  26.43 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  28.04 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  26.89 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  26.64 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  26.82 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2549  cyclase family protein  28.89 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.564227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  25.88 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  25.94 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  31.37 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  30.21 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  31.71 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  27.12 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  26.42 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  27.27 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  25.59 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  29.72 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  30.52 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  30.52 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  30.95 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  30.69 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  30.25 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  27.31 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  30.21 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  30.29 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  23.94 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  25.88 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  27.57 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  31.25 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>