176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2300 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  100 
 
 		 253 aa  523  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  97.23 
 
 		 253 aa  492  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  52.94 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  50.2 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  48.83 
 
 		 260 aa  242  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  48.05 
 
 		 258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  48.05 
 
 		 287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  46.48 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  47.45 
 
 		 254 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  46.88 
 
 		 283 aa  236  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  46.36 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  46.92 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  46.48 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  45.53 
 
 		 262 aa  232  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  47.48 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  46.69 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  46.06 
 
 		 262 aa  229  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  46.69 
 
 		 259 aa  228  9e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  45.98 
 
 		 268 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  46.67 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  44.57 
 
 		 258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  42.69 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  46.25 
 
 		 271 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  44.57 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  42.91 
 
 		 253 aa  218  5e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  45.15 
 
 		 268 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  45.15 
 
 		 268 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  44.75 
 
 		 263 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  42.17 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  43.63 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  41.96 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  45.53 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  30.54 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  28.94 
 
 		 233 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  28.51 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  28.63 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  33.33 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  28.57 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  31.55 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  31.71 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  30.85 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  30.15 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  29.7 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  27.4 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  30.4 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  29.02 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  26.5 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  29.8 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  34.98 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  27.51 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  27.88 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  32.46 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  24.9 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  29.85 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  29.35 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  28 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  24.9 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  26.13 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  27.23 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  31.34 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  26.67 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  26.67 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  30.35 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  26.67 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  30.43 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  26.67 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  29.13 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  24.42 
 
 		 210 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  31.31 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  24.88 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  26.67 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  24.39 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  26.7 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  25.73 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  25.98 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  31.82 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  30.89 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  31.22 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  23.88 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  22.5 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  26.94 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  24.14 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  29.25 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  23.33 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  24.88 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  28.85 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  28.29 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  32.56 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  27.16 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  25.35 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  25.24 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  25.24 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  27.38 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  30.8 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  26.73 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  27.23 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  29.81 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  24.75 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  24.91 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  25.24 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>