226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0042 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  100 
 
 		 226 aa  447  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  64.76 
 
 		 227 aa  295  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  62.83 
 
 		 237 aa  294  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  57.96 
 
 		 226 aa  280  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  57.08 
 
 		 226 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  46.08 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  46.08 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  42.23 
 
 		 209 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  40.28 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  44.93 
 
 		 210 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  42.23 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  42.93 
 
 		 208 aa  166  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  42.93 
 
 		 208 aa  166  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  42.23 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  44.71 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  39.11 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  45.54 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  38.12 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  41.55 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  36.63 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  37.62 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  37.13 
 
 		 209 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  36.14 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  36.14 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  37.62 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  37.13 
 
 		 209 aa  141  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  36.14 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  37.13 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  36.63 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  42.08 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  34.76 
 
 		 205 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  35.12 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  40.76 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  39.51 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  39.52 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  36.4 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  39.13 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  38.65 
 
 		 213 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  38.65 
 
 		 213 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  38.65 
 
 		 213 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  38.65 
 
 		 213 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  38.21 
 
 		 203 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  38.16 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  38.28 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  38.65 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  37.2 
 
 		 213 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  37.2 
 
 		 213 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  36.45 
 
 		 211 aa  121  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0710  arylformamidase  35.92 
 
 		 209 aa  121  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  37.2 
 
 		 213 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  37.68 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  34.93 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  37.2 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  34.95 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  37.26 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  37.2 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  37.25 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1894  cyclase family protein  35.78 
 
 		 190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853082  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1470  cyclase family protein  35.61 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0422652  normal  0.0295525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  36.97 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  33.01 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0508  arylformamidase  36.19 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24803  normal  0.0492636 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  36.44 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  41.21 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  34.62 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  35.07 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1390  putative cyclase  36.23 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00456524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  36.06 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  35.98 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  37.35 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  34.63 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0809  putative cyclase  36.19 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37590  kynurenine formamidase, KynB  36.06 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  36.94 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  33.66 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  35.19 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  27.54 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  35.65 
 
 		 377 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  31.28 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  27.05 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  27.05 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  27.05 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  27.05 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  27.05 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  27.05 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  27.54 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  32.35 
 
 		 176 aa  102  6e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  26.57 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  33.82 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  32.54 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  26.57 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  37.21 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  37.32 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  34.08 
 
 		 216 aa  98.6  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  26.79 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  29.11 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3018  cyclase family protein  34.74 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  29.39 
 
 		 236 aa  96.3  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2165  arylformamidase  30.48 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  28.77 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>