159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1390 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1390  putative cyclase  100 
 
 
209 aa  422  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00456524  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1470  cyclase family protein  54.81 
 
 
209 aa  230  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0422652  normal  0.0295525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  48.54 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0809  putative cyclase  50.49 
 
 
219 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  48.84 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1449  arylformamidase  48.11 
 
 
217 aa  193  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  49.52 
 
 
213 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  49.52 
 
 
213 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  51.2 
 
 
213 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  50 
 
 
213 aa  191  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  49.52 
 
 
213 aa  191  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2438  arylformamidase  48.11 
 
 
223 aa  191  7e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  51.21 
 
 
209 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  50 
 
 
213 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  50.24 
 
 
213 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2165  arylformamidase  48.58 
 
 
209 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267222  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  52.88 
 
 
209 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  50.24 
 
 
242 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  48.56 
 
 
242 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0710  arylformamidase  48.79 
 
 
209 aa  184  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  48.56 
 
 
255 aa  184  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  48.08 
 
 
213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  48.08 
 
 
213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  48.08 
 
 
213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  48.08 
 
 
213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  47.6 
 
 
242 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  47.12 
 
 
212 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  47.12 
 
 
212 aa  178  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37590  kynurenine formamidase, KynB  48.06 
 
 
213 aa  174  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  47.57 
 
 
213 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0508  arylformamidase  45.45 
 
 
209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24803  normal  0.0492636 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3018  cyclase family protein  45.41 
 
 
223 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  42.65 
 
 
201 aa  148  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  40.39 
 
 
209 aa  148  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  39.8 
 
 
209 aa  147  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  40 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  39.9 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  39.61 
 
 
209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  39.61 
 
 
209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  39.9 
 
 
209 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  39.71 
 
 
209 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  40 
 
 
209 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  39.41 
 
 
209 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  38.92 
 
 
209 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  45.63 
 
 
200 aa  142  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  42 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  36.97 
 
 
227 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  31.88 
 
 
226 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  31.02 
 
 
215 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  35.1 
 
 
237 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  30.92 
 
 
226 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  36.23 
 
 
226 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  31.53 
 
 
205 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  31.07 
 
 
210 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  31.75 
 
 
216 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  32.02 
 
 
217 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  26.73 
 
 
215 aa  102  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  31.6 
 
 
213 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  33.66 
 
 
205 aa  100  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  29.76 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  32.11 
 
 
213 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  32.11 
 
 
213 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1894  cyclase family protein  30.39 
 
 
190 aa  94.7  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  28.57 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  30.58 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  29.86 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  29.86 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  29.19 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  27.49 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  27.47 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  28.97 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  30.58 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  30.69 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  29.56 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  27.23 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  31.35 
 
 
223 aa  77  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  28.5 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  28.77 
 
 
219 aa  74.7  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  26.21 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  29.05 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  24.88 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  30.29 
 
 
208 aa  72  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  28.3 
 
 
220 aa  72  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  23.33 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  23.67 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  28.71 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  23.94 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  33.5 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  30.1 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  23.83 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  32.86 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  30.48 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  23.83 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  22.82 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  22.82 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  22.82 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  22.82 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  31.82 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  26.27 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  23.3 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>