171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0760 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  417  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  91.39 
 
 		 209 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0710  arylformamidase  90.43 
 
 		 209 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  75.85 
 
 		 213 aa  307  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  75.36 
 
 		 242 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  75.36 
 
 		 242 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  74.88 
 
 		 213 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  74.88 
 
 		 213 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  74.88 
 
 		 213 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  74.88 
 
 		 213 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  75.36 
 
 		 213 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  74.4 
 
 		 213 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  74.4 
 
 		 213 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  73.91 
 
 		 242 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  74.4 
 
 		 213 aa  300  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  74.4 
 
 		 213 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0809  putative cyclase  75 
 
 		 219 aa  299  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  73.91 
 
 		 255 aa  298  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  73.3 
 
 		 213 aa  295  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37590  kynurenine formamidase, KynB  72.68 
 
 		 213 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  71.71 
 
 		 213 aa  291  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  69.23 
 
 		 212 aa  287  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  69.08 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0508  arylformamidase  68.93 
 
 		 209 aa  278  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24803  normal  0.0492636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  61.17 
 
 		 221 aa  243  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2165  arylformamidase  60.77 
 
 		 209 aa  241  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2438  arylformamidase  59.42 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1449  arylformamidase  58.94 
 
 		 217 aa  231  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3018  cyclase family protein  59.02 
 
 		 223 aa  231  7.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  57.42 
 
 		 216 aa  225  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1470  cyclase family protein  57.97 
 
 		 209 aa  220  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0422652  normal  0.0295525 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1390  putative cyclase  52.88 
 
 		 209 aa  188  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00456524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  42.03 
 
 		 209 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  42.03 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  41.55 
 
 		 209 aa  167  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  45.54 
 
 		 201 aa  168  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  41.55 
 
 		 209 aa  167  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  41.06 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  41.55 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  41.55 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  41.55 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  41.06 
 
 		 209 aa  164  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  41.06 
 
 		 209 aa  164  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  41.15 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  43.07 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  43.5 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  33.01 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  33.01 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  32.24 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  37.98 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  29.61 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  32.06 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  30.85 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  34.63 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  30.35 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  34.15 
 
 		 237 aa  104  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  33.82 
 
 		 204 aa  101  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  29.13 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  33.33 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  32.21 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  32.54 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  31.84 
 
 		 205 aa  94.7  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  26.87 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  26.34 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  29.63 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  29.63 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  25.96 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  37.35 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1894  cyclase family protein  29.13 
 
 		 190 aa  85.1  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853082  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  28.16 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  28.22 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  35.98 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  32.14 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  31.1 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  27.16 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  29.45 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  28.66 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  27.66 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  29.41 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  28.71 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  29.76 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  30.88 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  26.54 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  28.78 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  26.05 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  24.19 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  32.11 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  25.58 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  27.78 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  28.51 
 
 		 377 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  28.64 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  29.19 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  29.15 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  27.39 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  27.01 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  34.8 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  26.32 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  29.48 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  27.91 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  27.59 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>