153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3227 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  100 
 
 		 212 aa  421  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  94.81 
 
 		 212 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0508  arylformamidase  88.46 
 
 		 209 aa  370  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24803  normal  0.0492636 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  81.82 
 
 		 213 aa  348  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  81.82 
 
 		 213 aa  345  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  81.82 
 
 		 213 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  81.82 
 
 		 213 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  82.3 
 
 		 213 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  81.34 
 
 		 213 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  79.15 
 
 		 242 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  79.62 
 
 		 242 aa  341  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  80.86 
 
 		 213 aa  341  5e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  79.15 
 
 		 242 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  79.15 
 
 		 213 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  79.15 
 
 		 213 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  79.15 
 
 		 213 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  79.15 
 
 		 213 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  79.15 
 
 		 255 aa  339  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0809  putative cyclase  70.73 
 
 		 219 aa  297  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  67.79 
 
 		 213 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37590  kynurenine formamidase, KynB  67.79 
 
 		 213 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0710  arylformamidase  68.12 
 
 		 209 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0776  arylformamidase  68.6 
 
 		 209 aa  285  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0200233  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0760  hypothetical protein  69.08 
 
 		 209 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.316703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2165  arylformamidase  59.02 
 
 		 209 aa  235  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  57.77 
 
 		 221 aa  233  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3018  cyclase family protein  56.1 
 
 		 223 aa  223  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2438  arylformamidase  55.5 
 
 		 223 aa  222  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  55.07 
 
 		 216 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1449  arylformamidase  54.59 
 
 		 217 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1470  cyclase family protein  51.67 
 
 		 209 aa  206  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0422652  normal  0.0295525 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1390  putative cyclase  47.12 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00456524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  46.31 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  40.87 
 
 		 209 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  40.3 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  40.3 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  40.8 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  39.51 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  40 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  39.51 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  40 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  39.51 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  39.02 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  41.9 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  38.42 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  42.79 
 
 		 200 aa  137  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  32.7 
 
 		 210 aa  124  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  34.76 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  34.76 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  36.92 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  31.68 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  36.23 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  35.07 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  31.19 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  33.8 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  35.07 
 
 		 226 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  32.7 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  34.26 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  31.43 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  31.43 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  27.67 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  34.31 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  30.77 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  35.5 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  34.48 
 
 		 205 aa  98.2  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  34.13 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  33.33 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  25.91 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  27.75 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1894  cyclase family protein  28.71 
 
 		 190 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  28.22 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  26.73 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  27.19 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  33.33 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  31.58 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  27.72 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  26.29 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  28.71 
 
 		 176 aa  77.8  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  28.86 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  28.84 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  26.27 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  26.09 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  33.03 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  27.04 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  30.41 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  29.78 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  27.93 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  28.44 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  27.67 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  26.13 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  26.83 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  30.14 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  24.63 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  25.65 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  22.22 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  26.32 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  26.79 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  30.14 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  28.74 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  28.85 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>