225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0275 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  481  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  35.65 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  35.5 
 
 
213 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  36.4 
 
 
226 aa  126  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  35.34 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  35.37 
 
 
227 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  34.91 
 
 
226 aa  122  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  32.47 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  32.47 
 
 
213 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  32.47 
 
 
213 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  31.76 
 
 
214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  33.77 
 
 
210 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  36.52 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  34.63 
 
 
210 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  30.87 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  33.47 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  33.33 
 
 
210 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  33.33 
 
 
210 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  31.74 
 
 
215 aa  109  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  33.48 
 
 
210 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  31.25 
 
 
215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  32.9 
 
 
210 aa  108  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  30.6 
 
 
210 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  33.33 
 
 
210 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  32.76 
 
 
213 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  32.16 
 
 
204 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  33.33 
 
 
210 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  30.74 
 
 
216 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  33.77 
 
 
207 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  30.26 
 
 
212 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  30.6 
 
 
220 aa  102  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  29.31 
 
 
216 aa  102  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  33.64 
 
 
223 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  30.26 
 
 
213 aa  99.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  30.04 
 
 
215 aa  99  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  30.87 
 
 
217 aa  98.6  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  30.6 
 
 
216 aa  98.2  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  27.07 
 
 
205 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  30.57 
 
 
176 aa  97.1  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  31.28 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  30.77 
 
 
208 aa  96.3  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  30.77 
 
 
208 aa  96.3  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  32.61 
 
 
213 aa  96.3  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  30.87 
 
 
209 aa  95.5  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  31 
 
 
201 aa  95.5  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  30.26 
 
 
213 aa  95.5  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  30.54 
 
 
377 aa  95.1  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  27.63 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  28.33 
 
 
205 aa  92.8  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  31.28 
 
 
209 aa  92  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  30.57 
 
 
209 aa  91.7  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  30.57 
 
 
209 aa  91.7  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  30.17 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  28.4 
 
 
216 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  30.84 
 
 
209 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  30.84 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  29.65 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1966  putative cyclase  28.07 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0789774  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2601  arylformamidase  27.63 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2625  cyclase family protein  27.51 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.452605  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2577  cyclase family protein  28.07 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  30.57 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2496  arylformamidase  27.51 
 
 
213 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605648  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  28.95 
 
 
242 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  30.84 
 
 
209 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  28.14 
 
 
217 aa  89.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  29.96 
 
 
209 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  32.05 
 
 
214 aa  88.6  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  31.14 
 
 
209 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  28.51 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  28.82 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  28.51 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  28.51 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  31.63 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  28.51 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  28.51 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  28.7 
 
 
221 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  28.51 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  27.19 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  29.96 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  28.51 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  26.2 
 
 
201 aa  85.9  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3206  arylformamidase  28.7 
 
 
213 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  31.8 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1470  cyclase family protein  27.83 
 
 
209 aa  84.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0422652  normal  0.0295525 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  28.65 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0824  cyclase family protein  33.19 
 
 
189 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.924773  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  30.67 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  31.58 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1550  cyclase family protein  31.44 
 
 
189 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0735  kynureninase  27.63 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0809  putative cyclase  26.52 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  27 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1390  putative cyclase  27.47 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00456524  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  28.95 
 
 
208 aa  82  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0720  arylformamidase  27.88 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  28.57 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  27.19 
 
 
212 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>