218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3365 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  100 
 
 
216 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  64.38 
 
 
377 aa  241  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  61.4 
 
 
214 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  41.2 
 
 
216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  45.54 
 
 
224 aa  144  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  40.45 
 
 
222 aa  138  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  47.6 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  40.38 
 
 
201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  40.95 
 
 
213 aa  132  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  39.73 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  39.72 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  39.23 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  41.01 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  40.76 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  37.84 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  35.19 
 
 
219 aa  115  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  33.33 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  28.37 
 
 
221 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  34.27 
 
 
226 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  35.75 
 
 
210 aa  108  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  35.62 
 
 
214 aa  108  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  33.33 
 
 
226 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  36.94 
 
 
226 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  35.87 
 
 
237 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  37.38 
 
 
217 aa  105  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  30.88 
 
 
219 aa  103  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  31.34 
 
 
213 aa  102  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  30.73 
 
 
210 aa  101  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  32.73 
 
 
212 aa  101  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  34.26 
 
 
227 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  34.56 
 
 
211 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  31.19 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  31.19 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  30.73 
 
 
210 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  30.73 
 
 
210 aa  98.6  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  30.73 
 
 
210 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  28.18 
 
 
213 aa  98.6  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  30.73 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  30.73 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  30.73 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  30.28 
 
 
210 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  36.41 
 
 
208 aa  95.1  7e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  26.73 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  27.36 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  32.56 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  32.56 
 
 
209 aa  92  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  32.26 
 
 
209 aa  92  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  31.34 
 
 
216 aa  91.7  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  28.4 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  32.56 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  34.39 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  33.02 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  32.56 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  31.63 
 
 
209 aa  89.4  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  34.25 
 
 
215 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  29.41 
 
 
236 aa  89  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  31.63 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  32.09 
 
 
209 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  31.63 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  34.39 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  31.63 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  24.77 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  33.63 
 
 
218 aa  86.3  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  29.17 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  30.91 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  36.32 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1127  cyclase family protein  26 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  36.28 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  35.02 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  27.88 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  31.56 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  36.28 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  35.65 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  30.67 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  36.28 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  36.28 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  36.28 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0824  cyclase family protein  27.5 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.924773  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  36.28 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1133  cyclase family protein  27.44 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  31.75 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0711  cyclase, putative  35.19 
 
 
255 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.442327  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  34.88 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  28.38 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1550  cyclase family protein  26.5 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  28.38 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  27.91 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  29.49 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0809  putative cyclase  31.63 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0249  hypothetical protein  27.98 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3227  arylformamidase  33.03 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  33.81 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  30.15 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  28.86 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1157  cyclase family protein  34.08 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.641654  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  24.55 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  28.64 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  33.33 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  34.08 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  28.37 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>