168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2580 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  100 
 
 
219 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  56.11 
 
 
219 aa  248  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  61.29 
 
 
218 aa  248  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  60 
 
 
237 aa  246  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1511  putative cyclase  59.53 
 
 
217 aa  244  8e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3685  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  58.18 
 
 
222 aa  241  9e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1500  cyclase family protein  58.22 
 
 
238 aa  232  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.256572  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  52.75 
 
 
295 aa  223  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  47.44 
 
 
228 aa  221  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  50.47 
 
 
294 aa  220  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2549  cyclase family protein  50.68 
 
 
216 aa  198  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.564227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3221  cyclase family protein  52.08 
 
 
216 aa  180  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  35 
 
 
217 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  30.77 
 
 
213 aa  99  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  32.1 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  35.68 
 
 
214 aa  96.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  33.04 
 
 
220 aa  94.7  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  34.98 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  31.98 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  33.18 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  24.77 
 
 
214 aa  89.4  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  31.44 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  30.67 
 
 
211 aa  89  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  30.94 
 
 
215 aa  89  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  30 
 
 
219 aa  86.7  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  32.26 
 
 
216 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  30.84 
 
 
217 aa  85.9  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  34.91 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  35.06 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  34.9 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  35.65 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  32.3 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  31.8 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  24.77 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  31.84 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  28.57 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  23.98 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  31.28 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  27.97 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  27.12 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  26.27 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  26.27 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  26.27 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  25.69 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  23.64 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  24.77 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  24.77 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  26.27 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  26.27 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  26.27 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  25.81 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  26.27 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  25.69 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  32.72 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1550  cyclase family protein  23.96 
 
 
189 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  24.42 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  26.89 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  23 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  29.25 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  24.44 
 
 
223 aa  64.7  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  30.43 
 
 
253 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  28.05 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  28.76 
 
 
222 aa  62.8  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1127  cyclase family protein  22.58 
 
 
189 aa  62.8  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  24.65 
 
 
226 aa  62.4  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  27.35 
 
 
233 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  25.12 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  34.93 
 
 
193 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  26.89 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  27.1 
 
 
253 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  31.11 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  26.39 
 
 
237 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  27.35 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  24.19 
 
 
205 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  24.29 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1133  cyclase family protein  22.37 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  26.98 
 
 
210 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  28 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  23.94 
 
 
209 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0824  cyclase family protein  23.04 
 
 
189 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.924773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  23.47 
 
 
209 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  26.14 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  21.19 
 
 
243 aa  57  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  23.47 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  25 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  24.68 
 
 
230 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  28.27 
 
 
264 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  26.75 
 
 
254 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  23 
 
 
209 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  26.89 
 
 
215 aa  55.8  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  37.21 
 
 
269 aa  55.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  31.82 
 
 
276 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3386  cyclase family protein  24.74 
 
 
223 aa  55.1  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  23.94 
 
 
209 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  23.61 
 
 
209 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  23 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  23 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  25.85 
 
 
287 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  23 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  23.61 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>