183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2548 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  100 
 
 		 253 aa  517  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  54.98 
 
 		 254 aa  293  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  47.84 
 
 		 260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  46.85 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  47.06 
 
 		 260 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  46.27 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  45.56 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  45.35 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  44.4 
 
 		 268 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  44.31 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  45.88 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  46.74 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  45.74 
 
 		 262 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  44.4 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  42.91 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  42.91 
 
 		 253 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  41.98 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  42.58 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  41.86 
 
 		 259 aa  205  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  42.47 
 
 		 275 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  46.81 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  43.7 
 
 		 263 aa  202  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  43.14 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  42.47 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  41.31 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  41.31 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  41.8 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  41.54 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  39.92 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  38.98 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  38.52 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  37.31 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  30.3 
 
 		 212 aa  89  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  33 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  29.03 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  33.84 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  30.07 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  30.62 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  29.85 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  25.39 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  30.12 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  34.83 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  26.77 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  31.91 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  32.29 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  29.41 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  29.02 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  28.78 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  33.01 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  28.71 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  26.2 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  29.12 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  27.61 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  28.51 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  26.02 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  27.76 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  30.15 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  30.89 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  24.87 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  31.35 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  32.49 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  30.54 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  26.52 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  27.63 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  30.04 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  29.76 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  32.86 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  26.61 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  26.34 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  23.81 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  21.05 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  30.27 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  29.13 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  25.89 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  26.98 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  28.46 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  27.88 
 
 		 280 aa  62  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  27.41 
 
 		 264 aa  62  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  25.98 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  35.77 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  25.12 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  31.61 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  25.76 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  25.91 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  29.74 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  27.1 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  26.73 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  25.62 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  27.66 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  30.48 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  24.4 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  26.34 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  26.34 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  27.27 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  27.23 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  26.74 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  25.59 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  29.69 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  29.27 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  30 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>