185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0313 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  100 
 
 		 256 aa  504  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  61.18 
 
 		 257 aa  320  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  57.25 
 
 		 257 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  57.65 
 
 		 257 aa  296  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  56.3 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  56.35 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  57.42 
 
 		 260 aa  278  7e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  53.36 
 
 		 260 aa  275  5e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  49.21 
 
 		 267 aa  245  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  49.02 
 
 		 259 aa  244  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  48.41 
 
 		 263 aa  241  6e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  47.11 
 
 		 268 aa  237  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  44.53 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  47.01 
 
 		 260 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  48.06 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  48.58 
 
 		 259 aa  231  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  42.58 
 
 		 270 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  46.22 
 
 		 259 aa  224  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  37.74 
 
 		 280 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  35.29 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  36.84 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  34.85 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  31.43 
 
 		 272 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  34.78 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  34.78 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  33.6 
 
 		 273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  31.71 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  33.49 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  32.82 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  31.3 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  36.51 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  31.22 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  34.76 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  33.67 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  31.05 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  31.05 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  29.55 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  31.63 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  30.35 
 
 		 249 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  35.45 
 
 		 248 aa  99.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  34.05 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  28.1 
 
 		 265 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  31.25 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  36.22 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  34.54 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  33 
 
 		 217 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  30.96 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  25.42 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  29.57 
 
 		 213 aa  87  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  30.54 
 
 		 264 aa  86.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  25.21 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  32.26 
 
 		 215 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  31.91 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  32.49 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  31.72 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  29.35 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  33.98 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  29.75 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  31.3 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  27.62 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  28.27 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  26.05 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  26.25 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  26.25 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  31.93 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  25 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  25 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  27.97 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  25 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  26.25 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  26.25 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  27.16 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  25 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  32.07 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  26.45 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  25.41 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  30.73 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  26.25 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  26.36 
 
 		 212 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  29.53 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  31.66 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  30.53 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  30.8 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  29.12 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  26.45 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  29.29 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  29.19 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  29.84 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  26.53 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  23.6 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  28.33 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  30.43 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  28.04 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  32 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  25.31 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  27.21 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  25.62 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  26.91 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  24.17 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  23.81 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>