164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2245 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  100 
 
 		 262 aa  532  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  49.05 
 
 		 287 aa  239  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  49.8 
 
 		 253 aa  236  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  49.8 
 
 		 253 aa  235  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  45.85 
 
 		 255 aa  222  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  46.07 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  45.49 
 
 		 260 aa  215  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  44.36 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  45.38 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  44.88 
 
 		 259 aa  213  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  44.74 
 
 		 262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  46.36 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  43.63 
 
 		 271 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  44.27 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  45.7 
 
 		 258 aa  204  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  45.85 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  42.97 
 
 		 261 aa  202  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  41.92 
 
 		 260 aa  198  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  42.41 
 
 		 262 aa  195  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  42.25 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  40.62 
 
 		 260 aa  192  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  40.62 
 
 		 258 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  41.31 
 
 		 275 aa  191  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  39.92 
 
 		 268 aa  191  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  41.31 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  41.31 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  40.62 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  41.54 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  39.23 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  39.15 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  38.04 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  38.3 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  35.29 
 
 		 210 aa  86.7  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  28.72 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  34.53 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  33.51 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  31.58 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  33.33 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  29.35 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  31.75 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  34.3 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  31.32 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  30.83 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  30.62 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  33.02 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  32.67 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  35.61 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  31.94 
 
 		 280 aa  72  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  30.45 
 
 		 231 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  32.14 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  31.25 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  25.4 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  31.79 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  29.1 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  28.17 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  32.11 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  31.07 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  27.98 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  28.19 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  29.39 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  30 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  31.75 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  29.35 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  28.72 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  28.36 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  24.21 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  26.44 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  36.88 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  26.44 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  26.07 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  26.07 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  26.07 
 
 		 210 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  26.07 
 
 		 210 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  28.36 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  29 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  25.29 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  26.07 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  25.29 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  37.12 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  26.05 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  26.69 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  25.21 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  25.21 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  26.56 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  35.16 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1127  cyclase family protein  26.67 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  26.98 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  23.51 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  30.92 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  28.93 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  26.63 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  27.16 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  31.25 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  26.36 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  28.31 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  25 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  27.05 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  23.41 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1550  cyclase family protein  25.89 
 
 		 189 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1511  putative cyclase  27.69 
 
 		 217 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3685  normal  0.674616 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>