180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3501 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  100 
 
 		 329 aa  676    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  61.59 
 
 		 335 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  58.39 
 
 		 329 aa  386  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  50.33 
 
 		 308 aa  324  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  33.68 
 
 		 270 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  32.28 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  33.78 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  33.64 
 
 		 319 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  31.56 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  32.31 
 
 		 342 aa  149  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  31.19 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  35.93 
 
 		 267 aa  145  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  29.39 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  31.18 
 
 		 314 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  31.18 
 
 		 314 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  29.59 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  33.09 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  33.45 
 
 		 273 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  33.33 
 
 		 269 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  35.45 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  29.24 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  29.38 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  29.06 
 
 		 332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  30.92 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  27.06 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  29.68 
 
 		 329 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  29.68 
 
 		 329 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  29.68 
 
 		 329 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  27.3 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  28.15 
 
 		 265 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  28.01 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  29.28 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  29.28 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  26.79 
 
 		 318 aa  105  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  28.16 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  28.52 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  28.03 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  26.28 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  28.12 
 
 		 287 aa  99  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  27.1 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  25.67 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  28.06 
 
 		 344 aa  89.4  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  26.07 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  26.09 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  27 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  25.58 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  26.02 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  26.3 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  27.43 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  26.25 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  25.6 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  26.85 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  25.8 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  25.94 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  24.54 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  24.62 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  23.93 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  25.91 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  27.27 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  26.46 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  28.73 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  23.93 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  24.23 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  24.23 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  26.24 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  24.23 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  24.63 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  26.44 
 
 		 226 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  29.86 
 
 		 210 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  22.78 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  27.16 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  25.21 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  27.96 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  23.3 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  28.44 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  28.91 
 
 		 208 aa  58.9  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  25.59 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  24 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  27.73 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  27.19 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  28.5 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  27.18 
 
 		 214 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  25.36 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0099  hypothetical protein  26.38 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  27.4 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  30.77 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  30.77 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  26.44 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  28.05 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  25.51 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  27.27 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  27.27 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  24.08 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  25.71 
 
 		 213 aa  55.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  27.59 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  22.03 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  25.79 
 
 		 260 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  30 
 
 		 209 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  24.42 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>