89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3546 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  100 
 
 
344 aa  691    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  45.91 
 
 
321 aa  255  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  45 
 
 
318 aa  235  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  41.81 
 
 
332 aa  223  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  42.06 
 
 
332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  42.41 
 
 
287 aa  215  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  41.89 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  41.89 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  41.89 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  41.8 
 
 
311 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  42.49 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  36.68 
 
 
327 aa  162  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  36.91 
 
 
317 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  33.23 
 
 
320 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  33.02 
 
 
322 aa  152  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  34.27 
 
 
320 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  34.78 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  34.25 
 
 
307 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  33.82 
 
 
336 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  33.82 
 
 
335 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  33.83 
 
 
344 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  33.82 
 
 
345 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  33.83 
 
 
336 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  33.24 
 
 
336 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  33.24 
 
 
335 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  32.65 
 
 
342 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  32.47 
 
 
344 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  29.74 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  29.45 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  32.95 
 
 
352 aa  109  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  29.69 
 
 
354 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  31.64 
 
 
350 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  28.62 
 
 
312 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  28.38 
 
 
320 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  31.75 
 
 
308 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  29.75 
 
 
343 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  29.94 
 
 
356 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  28.01 
 
 
321 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  32.07 
 
 
342 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  31.12 
 
 
348 aa  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  32.33 
 
 
309 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  31.52 
 
 
341 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  31.76 
 
 
340 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  30.62 
 
 
352 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  29.39 
 
 
340 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  30.45 
 
 
335 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  30.57 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  30.79 
 
 
372 aa  98.6  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  26.97 
 
 
311 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  29.45 
 
 
319 aa  96.3  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  29.43 
 
 
362 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  29.43 
 
 
362 aa  95.5  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  31.94 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  29.3 
 
 
353 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  27.92 
 
 
314 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  27.92 
 
 
314 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  28.06 
 
 
329 aa  89.4  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  29.48 
 
 
342 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  28.1 
 
 
351 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  28.1 
 
 
351 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  33.62 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01054  conserved hypothetical protein  27.62 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  27.56 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  26.95 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  29.7 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  27.81 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  29.27 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  25.38 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  27.53 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0099  hypothetical protein  29.47 
 
 
327 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0377  hypothetical protein  36.8 
 
 
127 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1716  hypothetical protein  36.8 
 
 
127 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0106358  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0343  hypothetical protein  36.8 
 
 
127 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1526  hypothetical protein  36.8 
 
 
127 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  32.95 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  27.44 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  29.43 
 
 
267 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10146  conserved hypothetical protein  24.77 
 
 
326 aa  59.7  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0965  hypothetical protein  33.89 
 
 
248 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1251  hypothetical protein  33.89 
 
 
248 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.378284  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1948  hypothetical protein  32.76 
 
 
239 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645975  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2226  hypothetical protein  33.89 
 
 
248 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.906086  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0143  hypothetical protein  30.67 
 
 
209 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0202764  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  27.04 
 
 
270 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  28.99 
 
 
256 aa  46.2  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  31.45 
 
 
257 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  29.37 
 
 
222 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  31.21 
 
 
257 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>