58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1251 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0965  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  503  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1251  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  503  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.378284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2226  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  503  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.906086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1948  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645975  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  98.6 
 
 
345 aa  427  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  98.6 
 
 
344 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  99.02 
 
 
336 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  98.54 
 
 
335 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  98.04 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  82.04 
 
 
336 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  81.3 
 
 
335 aa  387  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  72.68 
 
 
340 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  56.36 
 
 
372 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  54.07 
 
 
342 aa  221  8e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  53.59 
 
 
341 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  53.11 
 
 
342 aa  214  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  50.51 
 
 
344 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  51.87 
 
 
356 aa  206  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  48.42 
 
 
342 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  49.54 
 
 
354 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  47.42 
 
 
348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  47.44 
 
 
352 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  46.76 
 
 
353 aa  191  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  48.13 
 
 
350 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  47.44 
 
 
352 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  44.95 
 
 
362 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  44.95 
 
 
362 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  48.77 
 
 
340 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0143  hypothetical protein  42.86 
 
 
209 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0202764  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  31.64 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  32.97 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  31.61 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  32.43 
 
 
332 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  30.05 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  32.81 
 
 
329 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  32.81 
 
 
329 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  32.81 
 
 
329 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  31.38 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  30.05 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  33.89 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  29.63 
 
 
322 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  29.74 
 
 
351 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  29.74 
 
 
351 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01054  conserved hypothetical protein  32.31 
 
 
382 aa  62  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  30.88 
 
 
307 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  32.96 
 
 
318 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  27.65 
 
 
337 aa  57  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  31.79 
 
 
287 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  33.89 
 
 
344 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4008  hypothetical protein  49.18 
 
 
95 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281216  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  25.71 
 
 
311 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  22.38 
 
 
320 aa  50.4  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  28.35 
 
 
331 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  27.13 
 
 
311 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  27.91 
 
 
315 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  28.02 
 
 
309 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  25 
 
 
314 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  25 
 
 
314 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>