92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2432 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  100 
 
 		 315 aa  637    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  91.11 
 
 		 311 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  77.43 
 
 		 319 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  63.17 
 
 		 321 aa  421  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  52.6 
 
 		 312 aa  322  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  53.98 
 
 		 320 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  51.04 
 
 		 311 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  51.79 
 
 		 314 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  51.79 
 
 		 314 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  38.1 
 
 		 351 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  38.1 
 
 		 351 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  32.28 
 
 		 329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  36.36 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  31.53 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  31.74 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  31.48 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  34.67 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  29.59 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  32.82 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  29.67 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  30.34 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  33.02 
 
 		 329 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  33.02 
 
 		 329 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  33.02 
 
 		 329 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  32.5 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  29.97 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  28.38 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  31.66 
 
 		 332 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  30.16 
 
 		 331 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  30.56 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  29.74 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  27.57 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  31.42 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  27.54 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  27.3 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  29.55 
 
 		 267 aa  99  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  29.19 
 
 		 287 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  28.48 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  27.88 
 
 		 327 aa  96.3  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  29.43 
 
 		 265 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  26.38 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  26.8 
 
 		 317 aa  92.8  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  26.3 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  26.32 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  26.82 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  25.52 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  29.78 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  24.33 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  25.94 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  26.77 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  27.78 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  27.05 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  24.79 
 
 		 354 aa  75.9  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  24.44 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  24.21 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  25.99 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  25.69 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  26.14 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  26.3 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  26.14 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  23.08 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  25.51 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  24.05 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  22.54 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0099  hypothetical protein  24.65 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  23.08 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  27.44 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  24.76 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  22.16 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  23.6 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  22.16 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  23.3 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  24.1 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  30.83 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01054  conserved hypothetical protein  23.16 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  28.14 
 
 		 213 aa  54.3  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  27.09 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  35.56 
 
 		 216 aa  47.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2226  hypothetical protein  27.91 
 
 		 248 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.906086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1948  hypothetical protein  27.91 
 
 		 239 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645975  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1251  hypothetical protein  27.91 
 
 		 248 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.378284  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0965  hypothetical protein  27.91 
 
 		 248 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  32.64 
 
 		 220 aa  45.8  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  26.92 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  34.25 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  31.96 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1342  hypothetical protein  44.26 
 
 		 68 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0259834 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  27.86 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  28.78 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  24.19 
 
 		 201 aa  42.7  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10146  conserved hypothetical protein  21.33 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  26.77 
 
 		 215 aa  42.7  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>