90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3781 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  674    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  674    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  674    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  73.86 
 
 
332 aa  511  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  73.86 
 
 
332 aa  512  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  43.81 
 
 
287 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  40.84 
 
 
321 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  41.19 
 
 
311 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  40.24 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  41.89 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  36.42 
 
 
320 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  34.88 
 
 
322 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  39.01 
 
 
331 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  36.14 
 
 
320 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  34.43 
 
 
317 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  35.83 
 
 
322 aa  169  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  34.17 
 
 
327 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  34.44 
 
 
318 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  33.53 
 
 
309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  33.91 
 
 
336 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  33.91 
 
 
335 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  32.24 
 
 
352 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  32.68 
 
 
354 aa  143  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  33.71 
 
 
372 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  34.77 
 
 
336 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  34.77 
 
 
345 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  34.2 
 
 
344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  34.2 
 
 
335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  34.2 
 
 
336 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  32.46 
 
 
342 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  33.91 
 
 
340 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  31.23 
 
 
350 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  32.82 
 
 
307 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  33.05 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  32.08 
 
 
342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  31.1 
 
 
341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  31.83 
 
 
356 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  33.02 
 
 
315 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  32.39 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  30.77 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  29.97 
 
 
362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  29.97 
 
 
362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  29.25 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  31.71 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  29.44 
 
 
352 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  33.72 
 
 
340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  31.29 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  29.43 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  29.68 
 
 
329 aa  109  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  30.08 
 
 
353 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  29.38 
 
 
311 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  29.87 
 
 
312 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  34.55 
 
 
269 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  33.63 
 
 
280 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  34.53 
 
 
270 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  28.93 
 
 
320 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  32.17 
 
 
343 aa  97.1  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  32.2 
 
 
335 aa  96.7  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  29.6 
 
 
329 aa  96.3  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  30.28 
 
 
323 aa  95.9  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  32.57 
 
 
273 aa  93.6  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  27.63 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  27.63 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  30.47 
 
 
342 aa  90.1  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  26.09 
 
 
320 aa  89.7  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0099  hypothetical protein  29.01 
 
 
327 aa  89.7  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  33.48 
 
 
267 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  27.78 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  27.78 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  25.93 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01054  conserved hypothetical protein  26.92 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  28.82 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10146  conserved hypothetical protein  25.99 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  31.05 
 
 
265 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0343  hypothetical protein  38.4 
 
 
127 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1716  hypothetical protein  38.4 
 
 
127 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0106358  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1526  hypothetical protein  38.4 
 
 
127 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0377  hypothetical protein  38.4 
 
 
127 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  32.74 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  25.68 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1251  hypothetical protein  32.81 
 
 
248 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.378284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2226  hypothetical protein  32.81 
 
 
248 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.906086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1948  hypothetical protein  32.81 
 
 
239 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645975  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0965  hypothetical protein  32.81 
 
 
248 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  25.69 
 
 
220 aa  47.4  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  32.39 
 
 
249 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  28.46 
 
 
223 aa  45.8  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  28.68 
 
 
262 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  25.62 
 
 
231 aa  42.7  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  34.15 
 
 
264 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>