89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5414 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  100 
 
 		 314 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  100 
 
 		 314 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  97.15 
 
 		 320 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  89.68 
 
 		 312 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  83.27 
 
 		 311 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  50.33 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  50.17 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  47.91 
 
 		 319 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  48.56 
 
 		 321 aa  299  5e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  34.06 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  34.06 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  31.18 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  30.07 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  30.79 
 
 		 398 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  30.18 
 
 		 308 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  30.77 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  29.81 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  30.95 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  30.63 
 
 		 342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  28.74 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  30.4 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  26.19 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  28.93 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  27.6 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  28.21 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  28.01 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  26.39 
 
 		 287 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  28.28 
 
 		 320 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  30.14 
 
 		 327 aa  96.3  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  27.92 
 
 		 344 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  27.8 
 
 		 273 aa  93.2  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  28.82 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  28.96 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  28.82 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  28.82 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  29.24 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  27.6 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  26.28 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  27.62 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  27.9 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  25.87 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  26.96 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  25.38 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  27.34 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  28.07 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  24.05 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  24.83 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  28.16 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0099  hypothetical protein  26.46 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  24.07 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  25.68 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  23.08 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  29.91 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  25.17 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  25.5 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  25.47 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  26.13 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  24.67 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  22.87 
 
 		 350 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  24.76 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  24.76 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  25.78 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  23.23 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  24.45 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  24.45 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  24.45 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  22.73 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  26.62 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  21.75 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  22.6 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  23.24 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  25.94 
 
 		 347 aa  57  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  21.68 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  21.68 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01054  conserved hypothetical protein  23.34 
 
 		 382 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  24.75 
 
 		 264 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10146  conserved hypothetical protein  20.2 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  32.05 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  29.86 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  29.41 
 
 		 253 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  26.79 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  32.43 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  30.65 
 
 		 262 aa  46.2  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  32.61 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  29.06 
 
 		 259 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  33.03 
 
 		 254 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0143  hypothetical protein  27.59 
 
 		 209 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  32.39 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  33.33 
 
 		 290 aa  42.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>