85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3024 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  688    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  88.01 
 
 		 342 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  80.41 
 
 		 341 aa  550  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  67.91 
 
 		 372 aa  476  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  68.29 
 
 		 356 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  61.14 
 
 		 350 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  61.24 
 
 		 354 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  60.51 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  60.34 
 
 		 353 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  57.26 
 
 		 352 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  57.26 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  57.26 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  55.72 
 
 		 344 aa  374  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  57.8 
 
 		 340 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  57.02 
 
 		 336 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  57.93 
 
 		 342 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  56.52 
 
 		 335 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  56.81 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  57.02 
 
 		 336 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  56.81 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  57.02 
 
 		 336 aa  361  8e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  56.52 
 
 		 335 aa  359  4e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  53.33 
 
 		 348 aa  352  7e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  57.82 
 
 		 340 aa  335  7.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1948  hypothetical protein  54.07 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645975  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0965  hypothetical protein  54.07 
 
 		 248 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2226  hypothetical protein  54.07 
 
 		 248 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.906086  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1251  hypothetical protein  54.07 
 
 		 248 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.378284  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0143  hypothetical protein  51.48 
 
 		 209 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  32.54 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0343  hypothetical protein  59.4 
 
 		 127 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0377  hypothetical protein  59.4 
 
 		 127 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1716  hypothetical protein  59.4 
 
 		 127 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0106358  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1526  hypothetical protein  59.4 
 
 		 127 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  31.83 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  31.62 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  32.08 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  32.08 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  31.75 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  32.08 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  30.45 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 		 337 aa  123  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01054  conserved hypothetical protein  26.44 
 
 		 382 aa  119  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  32.53 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  30.79 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  31.09 
 
 		 322 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  30.75 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  31.12 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  30.88 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  28.99 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  32.84 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  26.47 
 
 		 320 aa  106  8e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  31.44 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  27.4 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  32.07 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0099  hypothetical protein  29.11 
 
 		 327 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  26.1 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  27.27 
 
 		 307 aa  85.9  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  27.6 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.653188 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10146  conserved hypothetical protein  25.45 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  25.66 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  26.69 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  25.94 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4008  hypothetical protein  59.32 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281216  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  27.99 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  24.75 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  25.26 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  24.07 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  24.07 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  26.86 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  26.25 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  27.13 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  23.32 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  23.32 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  27.51 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  25 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  25.14 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  25.63 
 
 		 342 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  26.67 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  29.13 
 
 		 269 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  24.32 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  31.15 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  32.75 
 
 		 267 aa  46.6  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  29.55 
 
 		 273 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  24.35 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>