50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0143 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0143  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  51.48 
 
 		 342 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  50.58 
 
 		 342 aa  153  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  48.11 
 
 		 362 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  48.11 
 
 		 362 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  48.3 
 
 		 356 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  48.28 
 
 		 352 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  46.82 
 
 		 344 aa  146  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  48 
 
 		 353 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  46.43 
 
 		 341 aa  141  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  45.7 
 
 		 372 aa  141  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  51.16 
 
 		 340 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  45.4 
 
 		 354 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  46.55 
 
 		 352 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  45.35 
 
 		 340 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  49.66 
 
 		 348 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  46.41 
 
 		 342 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  44.51 
 
 		 350 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  42.44 
 
 		 336 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  42.44 
 
 		 336 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1948  hypothetical protein  42.86 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645975  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0965  hypothetical protein  42.86 
 
 		 248 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1251  hypothetical protein  42.86 
 
 		 248 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.378284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2226  hypothetical protein  42.86 
 
 		 248 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.906086  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  42.86 
 
 		 335 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  42.86 
 
 		 345 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  42.86 
 
 		 344 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  40.12 
 
 		 336 aa  111  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  39.88 
 
 		 335 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4008  hypothetical protein  52.86 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281216  normal  0.141218 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  37.84 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  33 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  36.27 
 
 		 321 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  30.67 
 
 		 344 aa  52  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01054  conserved hypothetical protein  32.54 
 
 		 382 aa  50.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  29.41 
 
 		 320 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  29.63 
 
 		 320 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  30.83 
 
 		 320 aa  47  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  26.35 
 
 		 332 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 		 343 aa  45.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  27.65 
 
 		 318 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  27.01 
 
 		 317 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  27.59 
 
 		 314 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  27.59 
 
 		 314 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  30 
 
 		 311 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  26.9 
 
 		 320 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  30.19 
 
 		 307 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  32.69 
 
 		 287 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  33.91 
 
 		 322 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  28.04 
 
 		 312 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>