97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4855 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4855  cyclase family protein  100 
 
 
320 aa  647    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0867808  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5448  putative cyclase  97.15 
 
 
314 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5414  cyclase family protein  97.15 
 
 
314 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0926  cyclase family protein  90.31 
 
 
312 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2025  cyclase family protein  83.74 
 
 
311 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761271  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2432  putative cyclase  50.94 
 
 
315 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  0.086653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4717  hypothetical protein  50.31 
 
 
319 aa  324  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718426  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3020  putative cyclase  51.29 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.653188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3668  putative polyketide cyclase  50 
 
 
321 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.670549  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4354  putative cyclase  34.11 
 
 
351 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4416  putative cyclase  34.11 
 
 
351 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225331  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  29.57 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2775  cyclase  30.23 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1287  putative cyclase  31.27 
 
 
398 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.468573  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0591  cyclase family protein  29.25 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4084  cyclase family protein  31.6 
 
 
280 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  31.67 
 
 
335 aa  135  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1165  cyclase family protein  31.96 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2952  putative cyclase SCIF3.09c  31.49 
 
 
318 aa  126  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019311 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  30.23 
 
 
269 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2102  cyclase family protein  27.39 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.29081  normal  0.93943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0352  putative cyclase  30.86 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746436  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0661  hypothetical protein  29.67 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474211  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4455  hypothetical protein  29 
 
 
320 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.875794  normal  0.0452854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1691  hypothetical protein  29.33 
 
 
320 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3546  cyclase SCIF309c  28.38 
 
 
344 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0929  hypothetical protein  31.02 
 
 
327 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2868  hypothetical protein  28.24 
 
 
317 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2682  cyclase family protein  26.64 
 
 
287 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8748  putative cyclase  27.33 
 
 
311 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0905009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3781  hypothetical protein  29.47 
 
 
329 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3785  hypothetical protein  29.47 
 
 
329 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0079208  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3854  hypothetical protein  29.47 
 
 
329 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381388  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1239  hypothetical protein  28.03 
 
 
322 aa  99.4  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  29.21 
 
 
273 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1553  hypothetical protein  29.05 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4240  hypothetical protein  28.97 
 
 
332 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2406  hypothetical protein  29.02 
 
 
332 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0433  hypothetical protein  27.52 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6632  cyclase family protein  26.12 
 
 
265 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115766  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3327  hypothetical protein  29.05 
 
 
323 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0321448  decreased coverage  0.00361328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  27.92 
 
 
267 aa  89.4  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5118  hypothetical protein  27.3 
 
 
342 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1999  cyclase family protein  24.92 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4678  hypothetical protein  25.29 
 
 
352 aa  82.4  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128593  normal  0.183965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4678  hypothetical protein  29.27 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3942  hypothetical protein  24.56 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.05744  normal  0.099663 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05060  conserved hypothetical protein  29.01 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103413  hitchhiker  0.0000000000000229017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3024  hypothetical protein  24.75 
 
 
342 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  29.6 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0099  hypothetical protein  26.07 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5324  hypothetical protein  23.78 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2579  metal-dependent hydrolase  25.97 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2893  hypothetical protein  24.83 
 
 
372 aa  73.2  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1814  hypothetical protein  24.92 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00302698 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1270  hypothetical protein  25.98 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2912  hypothetical protein  25.98 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2224  hypothetical protein  26.57 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3764  hypothetical protein  22.81 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0102457 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0716  hypothetical protein  25.73 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.582207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1718  hypothetical protein  24.23 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897514  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3027  hypothetical protein  25.68 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2232  hypothetical protein  26.27 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3037  hypothetical protein  25.68 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1259  hypothetical protein  25.68 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11053  conserved hypothetical protein  24.83 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270252  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1722  metal-dependent hydrolase  22.46 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00020  expressed protein  23.38 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00164795  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4953  hypothetical protein  27.21 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.682064  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1641  hypothetical protein  22.64 
 
 
352 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3848  hypothetical protein  22.74 
 
 
362 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3121  hypothetical protein  22.74 
 
 
362 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01054  conserved hypothetical protein  23.46 
 
 
382 aa  56.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0710075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  24.24 
 
 
264 aa  56.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05068  conserved hypothetical protein  25.47 
 
 
347 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000733902  hitchhiker  0.000114711 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3888  hypothetical protein  22.61 
 
 
353 aa  53.1  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273042  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  34.71 
 
 
258 aa  52.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  30.56 
 
 
283 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  31.62 
 
 
259 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  33.33 
 
 
255 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  26.34 
 
 
287 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  33.94 
 
 
254 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10146  conserved hypothetical protein  20.81 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  28.68 
 
 
253 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  33.8 
 
 
253 aa  45.8  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  30.65 
 
 
262 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  31.53 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  32.61 
 
 
236 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  30.63 
 
 
253 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0143  hypothetical protein  26.9 
 
 
209 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0202764  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  34.57 
 
 
260 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  30.65 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  32.35 
 
 
259 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  29.14 
 
 
260 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  30.83 
 
 
260 aa  42.7  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  26.9 
 
 
271 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1948  hypothetical protein  26.14 
 
 
239 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>