190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1641 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  100 
 
 		 254 aa  524  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  54.98 
 
 		 253 aa  293  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  47.45 
 
 		 253 aa  228  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  47.45 
 
 		 253 aa  228  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  49.42 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  50.43 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  44.27 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  42.13 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  40.39 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  40.78 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  40.39 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  42.35 
 
 		 260 aa  194  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  40 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  41.63 
 
 		 262 aa  191  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  40.76 
 
 		 275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  41.41 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  40.39 
 
 		 263 aa  188  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  39.77 
 
 		 271 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  40.76 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  40.76 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  39.22 
 
 		 258 aa  185  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  38.43 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  38.7 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  37.25 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  40.34 
 
 		 267 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  39.15 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  36.78 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  38.46 
 
 		 260 aa  178  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  36.78 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  39 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  35.11 
 
 		 253 aa  164  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  35.97 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  31.71 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  33.5 
 
 		 220 aa  86.3  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  33.33 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  32.94 
 
 		 233 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  33.33 
 
 		 212 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  31.52 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  28.08 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  29.67 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  29.52 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  27.5 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  30.15 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  32.82 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  26.5 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  26.27 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  26.91 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  28.3 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  28.63 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  30 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  27.84 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  33.16 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  29.07 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  26.44 
 
 		 216 aa  68.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  31.77 
 
 		 217 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  25.37 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  30.94 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  31.13 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  31.14 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  29.38 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  25.88 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  25.88 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  30.53 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  26.27 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  25.88 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  25.88 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  25.34 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  31.82 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  27.14 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  25.88 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  25.88 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  26.67 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  28.65 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  25.13 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  27.45 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  26.27 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  29.58 
 
 		 280 aa  62  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  26.48 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  31.41 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  28.64 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  26.64 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  28.72 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  26.61 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  26.73 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  27.49 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  27.09 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  27.09 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  29.79 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  31.5 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  31.25 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  29.15 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  25.88 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  25 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  30.69 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  27.89 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  29.32 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  25.87 
 
 		 201 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  28.5 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  26.89 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  23.96 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>