254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2083 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  434  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  43.4 
 
 
213 aa  178  5.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  44.98 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  42.25 
 
 
214 aa  164  9e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  39.13 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  40.48 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  36.79 
 
 
212 aa  136  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  38.53 
 
 
220 aa  132  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  31.43 
 
 
210 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  31.43 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  31.43 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  31.43 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  31.43 
 
 
210 aa  125  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  31.43 
 
 
210 aa  125  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  31.9 
 
 
210 aa  125  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  31.43 
 
 
210 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  31.43 
 
 
210 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  34.13 
 
 
216 aa  121  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  30.95 
 
 
210 aa  121  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  37.07 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  32.24 
 
 
213 aa  118  7e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  30.99 
 
 
216 aa  115  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  35.05 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  33.79 
 
 
210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  34.27 
 
 
294 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  32.69 
 
 
221 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  36.94 
 
 
224 aa  111  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  32.87 
 
 
216 aa  111  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  34.29 
 
 
205 aa  109  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  36.24 
 
 
214 aa  109  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  37.79 
 
 
216 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  29.2 
 
 
291 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  32.42 
 
 
217 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  33.33 
 
 
295 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  35.27 
 
 
219 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  36.11 
 
 
377 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  31.96 
 
 
229 aa  105  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  30.81 
 
 
214 aa  105  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  27.56 
 
 
276 aa  105  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  35.19 
 
 
222 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  33.53 
 
 
223 aa  104  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  33.64 
 
 
228 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  34.12 
 
 
210 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  32.86 
 
 
205 aa  98.2  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  32.38 
 
 
215 aa  98.2  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  26.59 
 
 
290 aa  98.2  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  31.72 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  34.1 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  31.46 
 
 
217 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  31.02 
 
 
205 aa  95.1  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1500  cyclase family protein  34.82 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.256572  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  29.46 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  28.77 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  29.82 
 
 
243 aa  92  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  30.11 
 
 
236 aa  92  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  29.13 
 
 
238 aa  90.9  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  35.43 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  35.18 
 
 
193 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  30.62 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  30.49 
 
 
237 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  33.49 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  30.62 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  32.24 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  33.19 
 
 
237 aa  89  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  31.9 
 
 
210 aa  88.6  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1511  putative cyclase  29.95 
 
 
217 aa  88.2  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3685  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  30.99 
 
 
226 aa  88.2  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  30.23 
 
 
210 aa  88.2  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  32.88 
 
 
264 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  33.33 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  30.23 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  31.82 
 
 
217 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  31.53 
 
 
203 aa  87  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  26.87 
 
 
237 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  29.52 
 
 
213 aa  85.9  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  33.49 
 
 
218 aa  84.7  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  29.91 
 
 
226 aa  84.7  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  32.31 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  32.86 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  30.67 
 
 
244 aa  82  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  28.37 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0894  arylformamidase  33.17 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.329738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0353  cyclase, putative  33.17 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0652  arylformamidase  33.17 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.228367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0100  arylformamidase  33.17 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0282167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2487  arylformamidase  33.17 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0897  arylformamidase  33.17 
 
 
242 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102698  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  27.9 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  30.84 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  28.57 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1055  cyclase, putative  32.69 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1127  cyclase family protein  28.77 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  29.63 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0824  cyclase family protein  29.58 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.924773  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  28.97 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  30.19 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  34.88 
 
 
233 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  30.58 
 
 
253 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  30.88 
 
 
204 aa  79  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  28.84 
 
 
265 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>