208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5193 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  100 
 
 
295 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  67.47 
 
 
294 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1511  putative cyclase  64.35 
 
 
217 aa  280  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3685  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  57.41 
 
 
219 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  55.41 
 
 
228 aa  254  9e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  52.75 
 
 
219 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  51.38 
 
 
237 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  52.27 
 
 
222 aa  215  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  49.54 
 
 
218 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1500  cyclase family protein  48.65 
 
 
238 aa  195  9e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.256572  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2549  cyclase family protein  41.82 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.564227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3221  cyclase family protein  46.02 
 
 
216 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  35.32 
 
 
211 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  35.32 
 
 
214 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  34.09 
 
 
212 aa  109  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  33.18 
 
 
213 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  33.02 
 
 
217 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  32.88 
 
 
217 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  28.83 
 
 
219 aa  102  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  31.96 
 
 
215 aa  102  9e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  32.24 
 
 
216 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  30.45 
 
 
213 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  30 
 
 
214 aa  99  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  29.03 
 
 
210 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  29.03 
 
 
210 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  28.57 
 
 
210 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  28.57 
 
 
210 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  28.57 
 
 
210 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  28.57 
 
 
210 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  34.06 
 
 
224 aa  93.6  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  28.57 
 
 
210 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  32.24 
 
 
226 aa  93.6  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  28.57 
 
 
210 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  32.71 
 
 
226 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  30.43 
 
 
217 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  31.56 
 
 
222 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  32.41 
 
 
213 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  28.38 
 
 
223 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  32.98 
 
 
249 aa  86.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  32.16 
 
 
229 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  31.78 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  33.04 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  29.67 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  31.43 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  30.09 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  29.61 
 
 
231 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  30 
 
 
220 aa  78.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  28.24 
 
 
216 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  29.79 
 
 
233 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  29.18 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  31.89 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  27.11 
 
 
219 aa  75.5  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  30.56 
 
 
215 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  28.24 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  30.13 
 
 
216 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  27.31 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  35.56 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  27.52 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  26.41 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  27.98 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  27.52 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  26.03 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  25 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  25.7 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  25.7 
 
 
209 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  25.11 
 
 
209 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0987  Kynurenine formamidase  30.11 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  25.7 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  25.7 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  27.68 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  31.11 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  26.97 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  27.27 
 
 
280 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  26.97 
 
 
250 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  26.97 
 
 
250 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  28.88 
 
 
230 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  24.69 
 
 
269 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  24.2 
 
 
209 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_581  cyclase  25.23 
 
 
209 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  23.74 
 
 
209 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  30.21 
 
 
192 aa  62.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  24.89 
 
 
209 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  24.43 
 
 
209 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  24.43 
 
 
209 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  24.9 
 
 
272 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  25.58 
 
 
226 aa  62.4  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  24.43 
 
 
209 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0985  cyclase family protein  27.57 
 
 
200 aa  62.4  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  24.9 
 
 
272 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  28.19 
 
 
231 aa  62.4  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  24.43 
 
 
209 aa  62.4  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  28.44 
 
 
213 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  28.44 
 
 
213 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  27.27 
 
 
208 aa  61.6  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  24.43 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  27.93 
 
 
237 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2550  cyclase family protein  25.11 
 
 
216 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  27.8 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>