144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0413 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  84.21 
 
 
247 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  57.26 
 
 
247 aa  268  5e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  56.07 
 
 
248 aa  267  8.999999999999999e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  52.26 
 
 
248 aa  252  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  53.16 
 
 
243 aa  245  6e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  50.84 
 
 
249 aa  244  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  46.86 
 
 
244 aa  227  2e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  43.62 
 
 
249 aa  223  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  44.21 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  45.34 
 
 
251 aa  211  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  43.75 
 
 
220 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  45.61 
 
 
244 aa  201  7e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  36.63 
 
 
287 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  33.04 
 
 
284 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  32.62 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  34.51 
 
 
308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  32.08 
 
 
237 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  34.73 
 
 
259 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  35.18 
 
 
320 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  35.23 
 
 
310 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  34.96 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  35.15 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0077  cyclase family protein  35.04 
 
 
303 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  34.9 
 
 
306 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  33.33 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  34.35 
 
 
268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  32.5 
 
 
267 aa  132  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  29.17 
 
 
275 aa  131  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  29.11 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  31.67 
 
 
270 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  33.89 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  32.22 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  34.95 
 
 
280 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  31.56 
 
 
260 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  33.75 
 
 
268 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  33.2 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  35.64 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  32.35 
 
 
257 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  30.3 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  29.49 
 
 
319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  29.31 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  29.65 
 
 
272 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  30.38 
 
 
257 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  29.65 
 
 
272 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  29.54 
 
 
256 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  30.38 
 
 
278 aa  105  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  28.76 
 
 
269 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  29.9 
 
 
268 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  33.33 
 
 
260 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  32.12 
 
 
259 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  31.05 
 
 
256 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  28.63 
 
 
280 aa  98.6  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  26.32 
 
 
231 aa  98.6  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  29.05 
 
 
264 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  29.46 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  26.98 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  27.35 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  27.88 
 
 
213 aa  77  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  28.63 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  27.56 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  26.29 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  28.28 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  30.05 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  25.53 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  25.53 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  25.66 
 
 
217 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  25.53 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  25.53 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  27.31 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  24.68 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  24.68 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  27.07 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  26.97 
 
 
295 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  25.91 
 
 
216 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  24.78 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  25.65 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  26.85 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  25.65 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  27.16 
 
 
294 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  24.26 
 
 
210 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  25.66 
 
 
215 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  28.45 
 
 
219 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  25.63 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  26.32 
 
 
216 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  23.95 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  24.24 
 
 
216 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  25.99 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  25.78 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  24.56 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  25.97 
 
 
214 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  25 
 
 
377 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  23.61 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  28.57 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  25.46 
 
 
267 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  25.93 
 
 
275 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  24.7 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  25.52 
 
 
216 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  26.64 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>