83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1082 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  100 
 
 		 247 aa  512  1e-144  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  69.49 
 
 		 248 aa  343  2e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  59.17 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  57.26 
 
 		 250 aa  268  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  57.26 
 
 		 250 aa  268  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  53.85 
 
 		 247 aa  262  4e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  47.74 
 
 		 243 aa  234  7e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  46.28 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  43.22 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  44.26 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  43.83 
 
 		 249 aa  209  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  42.62 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  45.22 
 
 		 244 aa  195  7e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  38.15 
 
 		 287 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  38.93 
 
 		 220 aa  159  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  36.56 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0077  cyclase family protein  38.43 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  37.6 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  38.15 
 
 		 320 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  37.5 
 
 		 310 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  31.74 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  30.17 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  36.51 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  35.44 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  35.44 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  30.94 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  31.6 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  34.3 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  33.33 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  29.26 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  28.14 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  33.92 
 
 		 273 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  28.76 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  32.43 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  32.64 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  30.45 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  30.58 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 272 aa  112  7.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  32.23 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  29.57 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  34.85 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  32.49 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  31.71 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  33.16 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  31.4 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  32.67 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  33.05 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  32.62 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  33.87 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  29.87 
 
 		 264 aa  99.8  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  28.03 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  27.44 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  32.56 
 
 		 278 aa  92.4  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  29.23 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  30.21 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  30.17 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  31.18 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  27.97 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  26.18 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  28.37 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  27.19 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  24.79 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  25.44 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  26.05 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  26.32 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  26.18 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  25.49 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  25.22 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  22.52 
 
 		 277 aa  48.9  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  26.9 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  28.43 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  24.08 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  24 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2549  cyclase family protein  26.8 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.564227 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  24.43 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  27.21 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  27.69 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  25.38 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  24.65 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  25.38 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  26.76 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  23.68 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  24.14 
 
 		 214 aa  42.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>